Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY3

ACTRT2, Actin-related protein T2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT2Q8TDY3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ACTRT2Q8TDY3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ACTRT2Q8TDY3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ACTRT2Q8TDY3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ACTRT2Q8TDY3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ACTRT2Q8TDY3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ACTRT2Q8TDY3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ACTRT2Q8TDY3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ACTRT2Q8TDY3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ACTRT2Q8TDY3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ACTRT2Q8TDY3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ACTRT2Q8TDY3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ACTRT2Q8TDY3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ACTRT2Q8TDY3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ACTRT2Q8TDY3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ACTRT2Q8TDY3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ACTRT2Q8TDY3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ACTRT2Q8TDY3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ACTRT2Q8TDY3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ACTRT2Q8TDY3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ACTRT2Q8TDY3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ACTRT2Q8TDY3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ACTRT2Q8TDY3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ACTRT2Q8TDY3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ACTRT2Q8TDY3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ACTRT2Q8TDY3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ACTRT2Q8TDY3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ACTRT2Q8TDY3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ACTRT2Q8TDY3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ACTRT2Q8TDY3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ACTRT2Q8TDY3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ACTRT2Q8TDY3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ACTRT2Q8TDY3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ACTRT2Q8TDY3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ACTRT2Q8TDY3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ACTRT2Q8TDY3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ACTRT2Q8TDY3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ACTRT2Q8TDY3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ACTRT2Q8TDY3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ACTRT2Q8TDY3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ACTRT2Q8TDY3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ACTRT2Q8TDY3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ACTRT2Q8TDY3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ACTRT2Q8TDY3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ACTRT2Q8TDY3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ACTRT2Q8TDY3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ACTRT2Q8TDY3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ACTRT2Q8TDY3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ACTRT2Q8TDY3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ACTRT2Q8TDY3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ACTRT2Q8TDY3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ACTRT2Q8TDY3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ACTRT2Q8TDY3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ACTRT2Q8TDY3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ACTRT2Q8TDY3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ACTRT2Q8TDY3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ACTRT2Q8TDY3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ACTRT2Q8TDY3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ACTRT2Q8TDY3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ACTRT2Q8TDY3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ACTRT2Q8TDY3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ACTRT2Q8TDY3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ACTRT2Q8TDY3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ACTRT2Q8TDY3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ACTRT2Q8TDY3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ACTRT2Q8TDY3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ACTRT2Q8TDY3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ACTRT2Q8TDY3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ACTRT2Q8TDY3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ACTRT2Q8TDY3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ACTRT2Q8TDY3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ACTRT2Q8TDY3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ACTRT2Q8TDY3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ACTRT2Q8TDY3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ACTRT2Q8TDY3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ACTRT2Q8TDY3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ACTRT2Q8TDY3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ACTRT2Q8TDY3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ACTRT2Q8TDY3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ACTRT2Q8TDY3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ACTRT2Q8TDY3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ACTRT2Q8TDY3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ACTRT2Q8TDY3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ACTRT2Q8TDY3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ACTRT2Q8TDY3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ACTRT2Q8TDY3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ACTRT2Q8TDY3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ACTRT2Q8TDY3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ACTRT2Q8TDY3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ACTRT2Q8TDY3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ACTRT2Q8TDY3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ACTRT2Q8TDY3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ACTRT2Q8TDY3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ACTRT2Q8TDY3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ACTRT2Q8TDY3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ACTRT2Q8TDY3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ACTRT2Q8TDY3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ACTRT2Q8TDY3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ACTRT2Q8TDY3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACTRT2Q8TDY3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms