Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9Z2

CCDC71L, Coiled-coil domain-containing protein 71L, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71LQ8N9Z2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC71LQ8N9Z2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC71LQ8N9Z2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC71LQ8N9Z2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC71LQ8N9Z2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC71LQ8N9Z2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC71LQ8N9Z2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC71LQ8N9Z2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC71LQ8N9Z2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC71LQ8N9Z2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC71LQ8N9Z2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC71LQ8N9Z2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC71LQ8N9Z2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC71LQ8N9Z2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC71LQ8N9Z2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC71LQ8N9Z2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC71LQ8N9Z2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC71LQ8N9Z2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC71LQ8N9Z2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC71LQ8N9Z2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC71LQ8N9Z2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC71LQ8N9Z2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC71LQ8N9Z2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC71LQ8N9Z2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC71LQ8N9Z2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC71LQ8N9Z2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC71LQ8N9Z2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC71LQ8N9Z2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC71LQ8N9Z2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC71LQ8N9Z2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC71LQ8N9Z2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC71LQ8N9Z2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC71LQ8N9Z2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC71LQ8N9Z2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC71LQ8N9Z2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC71LQ8N9Z2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC71LQ8N9Z2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC71LQ8N9Z2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC71LQ8N9Z2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC71LQ8N9Z2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC71LQ8N9Z2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC71LQ8N9Z2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC71LQ8N9Z2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC71LQ8N9Z2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC71LQ8N9Z2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC71LQ8N9Z2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC71LQ8N9Z2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC71LQ8N9Z2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC71LQ8N9Z2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC71LQ8N9Z2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC71LQ8N9Z2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC71LQ8N9Z2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC71LQ8N9Z2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC71LQ8N9Z2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC71LQ8N9Z2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC71LQ8N9Z2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC71LQ8N9Z2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC71LQ8N9Z2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC71LQ8N9Z2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC71LQ8N9Z2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC71LQ8N9Z2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC71LQ8N9Z2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC71LQ8N9Z2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC71LQ8N9Z2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC71LQ8N9Z2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC71LQ8N9Z2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC71LQ8N9Z2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC71LQ8N9Z2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC71LQ8N9Z2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC71LQ8N9Z2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC71LQ8N9Z2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC71LQ8N9Z2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC71LQ8N9Z2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC71LQ8N9Z2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC71LQ8N9Z2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC71LQ8N9Z2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC71LQ8N9Z2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC71LQ8N9Z2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC71LQ8N9Z2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC71LQ8N9Z2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC71LQ8N9Z2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC71LQ8N9Z2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC71LQ8N9Z2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC71LQ8N9Z2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC71LQ8N9Z2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC71LQ8N9Z2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC71LQ8N9Z2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC71LQ8N9Z2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC71LQ8N9Z2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC71LQ8N9Z2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC71LQ8N9Z2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC71LQ8N9Z2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC71LQ8N9Z2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC71LQ8N9Z2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC71LQ8N9Z2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC71LQ8N9Z2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC71LQ8N9Z2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC71LQ8N9Z2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC71LQ8N9Z2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC71LQ8N9Z2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms