Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
AMER3Q8N944 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AMER3Q8N944 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
AMER3Q8N944 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AMER3Q8N944 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AMER3Q8N944 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
AMER3Q8N944 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
AMER3Q8N944 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
AMER3Q8N944 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AMER3Q8N944 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AMER3Q8N944 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AMER3Q8N944 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
AMER3Q8N944 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
AMER3Q8N944 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AMER3Q8N944 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
AMER3Q8N944 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AMER3Q8N944 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AMER3Q8N944 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AMER3Q8N944 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AMER3Q8N944 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AMER3Q8N944 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AMER3Q8N944 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AMER3Q8N944 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
AMER3Q8N944 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
AMER3Q8N944 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AMER3Q8N944 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
AMER3Q8N944 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AMER3Q8N944 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
AMER3Q8N944 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
AMER3Q8N944 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AMER3Q8N944 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
AMER3Q8N944 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
AMER3Q8N944 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
AMER3Q8N944 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
AMER3Q8N944 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AMER3Q8N944 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AMER3Q8N944 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AMER3Q8N944 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
AMER3Q8N944 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
AMER3Q8N944 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
AMER3Q8N944 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
AMER3Q8N944 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AMER3Q8N944 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
AMER3Q8N944 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
AMER3Q8N944 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
AMER3Q8N944 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
AMER3Q8N944 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AMER3Q8N944 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
AMER3Q8N944 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AMER3Q8N944 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AMER3Q8N944 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
AMER3Q8N944 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
AMER3Q8N944 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
AMER3Q8N944 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
AMER3Q8N944 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
AMER3Q8N944 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AMER3Q8N944 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AMER3Q8N944 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
AMER3Q8N944 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
AMER3Q8N944 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
AMER3Q8N944 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
AMER3Q8N944 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AMER3Q8N944 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AMER3Q8N944 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AMER3Q8N944 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
AMER3Q8N944 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
AMER3Q8N944 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AMER3Q8N944 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
AMER3Q8N944 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AMER3Q8N944 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AMER3Q8N944 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AMER3Q8N944 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AMER3Q8N944 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AMER3Q8N944 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AMER3Q8N944 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
AMER3Q8N944 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AMER3Q8N944 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
AMER3Q8N944 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
AMER3Q8N944 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
AMER3Q8N944 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AMER3Q8N944 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AMER3Q8N944 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AMER3Q8N944 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AMER3Q8N944 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AMER3Q8N944 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
AMER3Q8N944 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
AMER3Q8N944 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
AMER3Q8N944 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AMER3Q8N944 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AMER3Q8N944 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AMER3Q8N944 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AMER3Q8N944 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AMER3Q8N944 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AMER3Q8N944 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AMER3Q8N944 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AMER3Q8N944 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AMER3Q8N944 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AMER3Q8N944 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
AMER3Q8N944 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
AMER3Q8N944 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms