Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8Q1

CYB561D1, Cytochrome b561 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYB561D1Q8N8Q1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYB561D1Q8N8Q1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYB561D1Q8N8Q1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYB561D1Q8N8Q1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYB561D1Q8N8Q1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYB561D1Q8N8Q1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYB561D1Q8N8Q1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYB561D1Q8N8Q1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYB561D1Q8N8Q1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYB561D1Q8N8Q1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYB561D1Q8N8Q1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYB561D1Q8N8Q1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYB561D1Q8N8Q1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYB561D1Q8N8Q1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYB561D1Q8N8Q1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYB561D1Q8N8Q1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYB561D1Q8N8Q1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYB561D1Q8N8Q1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYB561D1Q8N8Q1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYB561D1Q8N8Q1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYB561D1Q8N8Q1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CYB561D1Q8N8Q1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYB561D1Q8N8Q1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYB561D1Q8N8Q1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYB561D1Q8N8Q1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYB561D1Q8N8Q1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYB561D1Q8N8Q1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYB561D1Q8N8Q1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYB561D1Q8N8Q1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYB561D1Q8N8Q1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYB561D1Q8N8Q1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYB561D1Q8N8Q1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYB561D1Q8N8Q1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYB561D1Q8N8Q1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYB561D1Q8N8Q1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYB561D1Q8N8Q1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYB561D1Q8N8Q1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYB561D1Q8N8Q1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYB561D1Q8N8Q1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYB561D1Q8N8Q1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYB561D1Q8N8Q1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYB561D1Q8N8Q1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYB561D1Q8N8Q1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYB561D1Q8N8Q1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYB561D1Q8N8Q1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYB561D1Q8N8Q1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CYB561D1Q8N8Q1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYB561D1Q8N8Q1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYB561D1Q8N8Q1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYB561D1Q8N8Q1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYB561D1Q8N8Q1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYB561D1Q8N8Q1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYB561D1Q8N8Q1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYB561D1Q8N8Q1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYB561D1Q8N8Q1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYB561D1Q8N8Q1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYB561D1Q8N8Q1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYB561D1Q8N8Q1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CYB561D1Q8N8Q1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYB561D1Q8N8Q1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYB561D1Q8N8Q1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYB561D1Q8N8Q1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYB561D1Q8N8Q1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYB561D1Q8N8Q1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYB561D1Q8N8Q1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYB561D1Q8N8Q1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYB561D1Q8N8Q1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYB561D1Q8N8Q1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYB561D1Q8N8Q1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYB561D1Q8N8Q1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYB561D1Q8N8Q1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CYB561D1Q8N8Q1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYB561D1Q8N8Q1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYB561D1Q8N8Q1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYB561D1Q8N8Q1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYB561D1Q8N8Q1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYB561D1Q8N8Q1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYB561D1Q8N8Q1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYB561D1Q8N8Q1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYB561D1Q8N8Q1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYB561D1Q8N8Q1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYB561D1Q8N8Q1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYB561D1Q8N8Q1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYB561D1Q8N8Q1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYB561D1Q8N8Q1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYB561D1Q8N8Q1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYB561D1Q8N8Q1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYB561D1Q8N8Q1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYB561D1Q8N8Q1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYB561D1Q8N8Q1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYB561D1Q8N8Q1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYB561D1Q8N8Q1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYB561D1Q8N8Q1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYB561D1Q8N8Q1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYB561D1Q8N8Q1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYB561D1Q8N8Q1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYB561D1Q8N8Q1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYB561D1Q8N8Q1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYB561D1Q8N8Q1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYB561D1Q8N8Q1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms