Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8D1

PDCD7, Programmed cell death protein 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD7Q8N8D1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDCD7Q8N8D1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDCD7Q8N8D1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDCD7Q8N8D1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDCD7Q8N8D1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDCD7Q8N8D1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDCD7Q8N8D1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDCD7Q8N8D1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDCD7Q8N8D1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDCD7Q8N8D1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDCD7Q8N8D1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDCD7Q8N8D1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDCD7Q8N8D1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDCD7Q8N8D1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDCD7Q8N8D1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDCD7Q8N8D1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDCD7Q8N8D1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDCD7Q8N8D1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDCD7Q8N8D1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDCD7Q8N8D1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDCD7Q8N8D1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDCD7Q8N8D1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDCD7Q8N8D1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PDCD7Q8N8D1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDCD7Q8N8D1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDCD7Q8N8D1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDCD7Q8N8D1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDCD7Q8N8D1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDCD7Q8N8D1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDCD7Q8N8D1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDCD7Q8N8D1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDCD7Q8N8D1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDCD7Q8N8D1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDCD7Q8N8D1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDCD7Q8N8D1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDCD7Q8N8D1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDCD7Q8N8D1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDCD7Q8N8D1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDCD7Q8N8D1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDCD7Q8N8D1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDCD7Q8N8D1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDCD7Q8N8D1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDCD7Q8N8D1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDCD7Q8N8D1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDCD7Q8N8D1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDCD7Q8N8D1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDCD7Q8N8D1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDCD7Q8N8D1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDCD7Q8N8D1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDCD7Q8N8D1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDCD7Q8N8D1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDCD7Q8N8D1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDCD7Q8N8D1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDCD7Q8N8D1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDCD7Q8N8D1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDCD7Q8N8D1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDCD7Q8N8D1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDCD7Q8N8D1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDCD7Q8N8D1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDCD7Q8N8D1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDCD7Q8N8D1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PDCD7Q8N8D1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDCD7Q8N8D1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDCD7Q8N8D1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDCD7Q8N8D1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDCD7Q8N8D1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDCD7Q8N8D1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDCD7Q8N8D1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDCD7Q8N8D1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDCD7Q8N8D1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDCD7Q8N8D1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDCD7Q8N8D1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDCD7Q8N8D1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDCD7Q8N8D1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDCD7Q8N8D1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDCD7Q8N8D1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDCD7Q8N8D1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDCD7Q8N8D1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDCD7Q8N8D1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDCD7Q8N8D1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDCD7Q8N8D1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDCD7Q8N8D1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDCD7Q8N8D1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDCD7Q8N8D1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDCD7Q8N8D1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDCD7Q8N8D1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDCD7Q8N8D1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDCD7Q8N8D1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PDCD7Q8N8D1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDCD7Q8N8D1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PDCD7Q8N8D1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDCD7Q8N8D1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDCD7Q8N8D1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDCD7Q8N8D1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDCD7Q8N8D1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PDCD7Q8N8D1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDCD7Q8N8D1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PDCD7Q8N8D1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDCD7Q8N8D1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDCD7Q8N8D1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms