Protein–RNA interactions for Protein: Q8N535

LINC00471, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00471, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00471Q8N535 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LINC00471Q8N535 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LINC00471Q8N535 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LINC00471Q8N535 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LINC00471Q8N535 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00471Q8N535 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00471Q8N535 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LINC00471Q8N535 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LINC00471Q8N535 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LINC00471Q8N535 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LINC00471Q8N535 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LINC00471Q8N535 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LINC00471Q8N535 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LINC00471Q8N535 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LINC00471Q8N535 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC00471Q8N535 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC00471Q8N535 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC00471Q8N535 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LINC00471Q8N535 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LINC00471Q8N535 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LINC00471Q8N535 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LINC00471Q8N535 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LINC00471Q8N535 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LINC00471Q8N535 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC00471Q8N535 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC00471Q8N535 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LINC00471Q8N535 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LINC00471Q8N535 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC00471Q8N535 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC00471Q8N535 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC00471Q8N535 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC00471Q8N535 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC00471Q8N535 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC00471Q8N535 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC00471Q8N535 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINC00471Q8N535 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINC00471Q8N535 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINC00471Q8N535 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LINC00471Q8N535 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LINC00471Q8N535 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LINC00471Q8N535 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LINC00471Q8N535 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LINC00471Q8N535 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LINC00471Q8N535 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LINC00471Q8N535 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LINC00471Q8N535 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LINC00471Q8N535 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LINC00471Q8N535 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LINC00471Q8N535 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LINC00471Q8N535 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LINC00471Q8N535 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LINC00471Q8N535 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LINC00471Q8N535 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LINC00471Q8N535 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC00471Q8N535 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC00471Q8N535 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC00471Q8N535 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC00471Q8N535 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC00471Q8N535 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LINC00471Q8N535 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LINC00471Q8N535 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LINC00471Q8N535 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC00471Q8N535 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LINC00471Q8N535 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINC00471Q8N535 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LINC00471Q8N535 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINC00471Q8N535 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00471Q8N535 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00471Q8N535 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00471Q8N535 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00471Q8N535 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LINC00471Q8N535 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LINC00471Q8N535 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LINC00471Q8N535 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC00471Q8N535 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC00471Q8N535 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC00471Q8N535 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC00471Q8N535 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LINC00471Q8N535 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC00471Q8N535 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC00471Q8N535 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LINC00471Q8N535 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LINC00471Q8N535 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LINC00471Q8N535 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC00471Q8N535 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC00471Q8N535 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC00471Q8N535 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC00471Q8N535 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC00471Q8N535 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC00471Q8N535 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC00471Q8N535 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC00471Q8N535 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC00471Q8N535 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC00471Q8N535 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC00471Q8N535 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC00471Q8N535 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC00471Q8N535 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC00471Q8N535 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC00471Q8N535 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC00471Q8N535 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms