Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
SYNE4Q8N205 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC35.32■■■■□ 3.24
SYNE4Q8N205 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
SYNE4Q8N205 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SYNE4Q8N205 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SYNE4Q8N205 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SYNE4Q8N205 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SYNE4Q8N205 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SYNE4Q8N205 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SYNE4Q8N205 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SYNE4Q8N205 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
SYNE4Q8N205 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
SYNE4Q8N205 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SYNE4Q8N205 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SYNE4Q8N205 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SYNE4Q8N205 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SYNE4Q8N205 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SYNE4Q8N205 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SYNE4Q8N205 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SYNE4Q8N205 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SYNE4Q8N205 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
SYNE4Q8N205 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
SYNE4Q8N205 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
SYNE4Q8N205 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SYNE4Q8N205 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
SYNE4Q8N205 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SYNE4Q8N205 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SYNE4Q8N205 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SYNE4Q8N205 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
SYNE4Q8N205 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SYNE4Q8N205 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SYNE4Q8N205 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SYNE4Q8N205 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SYNE4Q8N205 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SYNE4Q8N205 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SYNE4Q8N205 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
SYNE4Q8N205 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
SYNE4Q8N205 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SYNE4Q8N205 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.93■■■■□ 3.18
SYNE4Q8N205 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
SYNE4Q8N205 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
SYNE4Q8N205 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SYNE4Q8N205 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SYNE4Q8N205 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SYNE4Q8N205 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SYNE4Q8N205 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
SYNE4Q8N205 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
SYNE4Q8N205 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
SYNE4Q8N205 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SYNE4Q8N205 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SYNE4Q8N205 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SYNE4Q8N205 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SYNE4Q8N205 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
SYNE4Q8N205 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SYNE4Q8N205 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SYNE4Q8N205 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
SYNE4Q8N205 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
SYNE4Q8N205 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
SYNE4Q8N205 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
SYNE4Q8N205 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SYNE4Q8N205 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
SYNE4Q8N205 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
SYNE4Q8N205 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
SYNE4Q8N205 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SYNE4Q8N205 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SYNE4Q8N205 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SYNE4Q8N205 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SYNE4Q8N205 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
SYNE4Q8N205 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SYNE4Q8N205 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SYNE4Q8N205 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
SYNE4Q8N205 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SYNE4Q8N205 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SYNE4Q8N205 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SYNE4Q8N205 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SYNE4Q8N205 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
SYNE4Q8N205 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
SYNE4Q8N205 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SYNE4Q8N205 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SYNE4Q8N205 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SYNE4Q8N205 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
SYNE4Q8N205 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SYNE4Q8N205 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SYNE4Q8N205 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SYNE4Q8N205 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SYNE4Q8N205 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
SYNE4Q8N205 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
SYNE4Q8N205 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SYNE4Q8N205 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
SYNE4Q8N205 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SYNE4Q8N205 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SYNE4Q8N205 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
SYNE4Q8N205 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SYNE4Q8N205 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SYNE4Q8N205 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SYNE4Q8N205 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SYNE4Q8N205 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SYNE4Q8N205 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SYNE4Q8N205 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
SYNE4Q8N205 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms