Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC117Q8IWD4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC117Q8IWD4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC117Q8IWD4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC117Q8IWD4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC117Q8IWD4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC117Q8IWD4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC117Q8IWD4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC117Q8IWD4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC117Q8IWD4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC117Q8IWD4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC117Q8IWD4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC117Q8IWD4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC117Q8IWD4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC117Q8IWD4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC117Q8IWD4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC117Q8IWD4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC117Q8IWD4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC117Q8IWD4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC117Q8IWD4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC117Q8IWD4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC117Q8IWD4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC117Q8IWD4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC117Q8IWD4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC117Q8IWD4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC117Q8IWD4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC117Q8IWD4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC117Q8IWD4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC117Q8IWD4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC117Q8IWD4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC117Q8IWD4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC117Q8IWD4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC117Q8IWD4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC117Q8IWD4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC117Q8IWD4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC117Q8IWD4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC117Q8IWD4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC117Q8IWD4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC117Q8IWD4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC117Q8IWD4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC117Q8IWD4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC117Q8IWD4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC117Q8IWD4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC117Q8IWD4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC117Q8IWD4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC117Q8IWD4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC117Q8IWD4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC117Q8IWD4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC117Q8IWD4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC117Q8IWD4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC117Q8IWD4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC117Q8IWD4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC117Q8IWD4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC117Q8IWD4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC117Q8IWD4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC117Q8IWD4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC117Q8IWD4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC117Q8IWD4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC117Q8IWD4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC117Q8IWD4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC117Q8IWD4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC117Q8IWD4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC117Q8IWD4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC117Q8IWD4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC117Q8IWD4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC117Q8IWD4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC117Q8IWD4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC117Q8IWD4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC117Q8IWD4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC117Q8IWD4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC117Q8IWD4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC117Q8IWD4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC117Q8IWD4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC117Q8IWD4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC117Q8IWD4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC117Q8IWD4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC117Q8IWD4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC117Q8IWD4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC117Q8IWD4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC117Q8IWD4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC117Q8IWD4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC117Q8IWD4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC117Q8IWD4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC117Q8IWD4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC117Q8IWD4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC117Q8IWD4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC117Q8IWD4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC117Q8IWD4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC117Q8IWD4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC117Q8IWD4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC117Q8IWD4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC117Q8IWD4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC117Q8IWD4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC117Q8IWD4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC117Q8IWD4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC117Q8IWD4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC117Q8IWD4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC117Q8IWD4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC117Q8IWD4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC117Q8IWD4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms