Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Q1

SLC46A3, Solute carrier family 46 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A3Q7Z3Q1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC46A3Q7Z3Q1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC46A3Q7Z3Q1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC46A3Q7Z3Q1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC46A3Q7Z3Q1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC46A3Q7Z3Q1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC46A3Q7Z3Q1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC46A3Q7Z3Q1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC46A3Q7Z3Q1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC46A3Q7Z3Q1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC46A3Q7Z3Q1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC46A3Q7Z3Q1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC46A3Q7Z3Q1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC46A3Q7Z3Q1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC46A3Q7Z3Q1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC46A3Q7Z3Q1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC46A3Q7Z3Q1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC46A3Q7Z3Q1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC46A3Q7Z3Q1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC46A3Q7Z3Q1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC46A3Q7Z3Q1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC46A3Q7Z3Q1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC46A3Q7Z3Q1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC46A3Q7Z3Q1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC46A3Q7Z3Q1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC46A3Q7Z3Q1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC46A3Q7Z3Q1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC46A3Q7Z3Q1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC46A3Q7Z3Q1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC46A3Q7Z3Q1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC46A3Q7Z3Q1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC46A3Q7Z3Q1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC46A3Q7Z3Q1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC46A3Q7Z3Q1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC46A3Q7Z3Q1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC46A3Q7Z3Q1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC46A3Q7Z3Q1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC46A3Q7Z3Q1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC46A3Q7Z3Q1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC46A3Q7Z3Q1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC46A3Q7Z3Q1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC46A3Q7Z3Q1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC46A3Q7Z3Q1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC46A3Q7Z3Q1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC46A3Q7Z3Q1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC46A3Q7Z3Q1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC46A3Q7Z3Q1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC46A3Q7Z3Q1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC46A3Q7Z3Q1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC46A3Q7Z3Q1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC46A3Q7Z3Q1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC46A3Q7Z3Q1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC46A3Q7Z3Q1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC46A3Q7Z3Q1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC46A3Q7Z3Q1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC46A3Q7Z3Q1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC46A3Q7Z3Q1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC46A3Q7Z3Q1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC46A3Q7Z3Q1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC46A3Q7Z3Q1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC46A3Q7Z3Q1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC46A3Q7Z3Q1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC46A3Q7Z3Q1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC46A3Q7Z3Q1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC46A3Q7Z3Q1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC46A3Q7Z3Q1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC46A3Q7Z3Q1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC46A3Q7Z3Q1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC46A3Q7Z3Q1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC46A3Q7Z3Q1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC46A3Q7Z3Q1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC46A3Q7Z3Q1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC46A3Q7Z3Q1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC46A3Q7Z3Q1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC46A3Q7Z3Q1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC46A3Q7Z3Q1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC46A3Q7Z3Q1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC46A3Q7Z3Q1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC46A3Q7Z3Q1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC46A3Q7Z3Q1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC46A3Q7Z3Q1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC46A3Q7Z3Q1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC46A3Q7Z3Q1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC46A3Q7Z3Q1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC46A3Q7Z3Q1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC46A3Q7Z3Q1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC46A3Q7Z3Q1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC46A3Q7Z3Q1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC46A3Q7Z3Q1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC46A3Q7Z3Q1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC46A3Q7Z3Q1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC46A3Q7Z3Q1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC46A3Q7Z3Q1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC46A3Q7Z3Q1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC46A3Q7Z3Q1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC46A3Q7Z3Q1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms