Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PDZD4Q76G19 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PDZD4Q76G19 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PDZD4Q76G19 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PDZD4Q76G19 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PDZD4Q76G19 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PDZD4Q76G19 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDZD4Q76G19 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDZD4Q76G19 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PDZD4Q76G19 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PDZD4Q76G19 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PDZD4Q76G19 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PDZD4Q76G19 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PDZD4Q76G19 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PDZD4Q76G19 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PDZD4Q76G19 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PDZD4Q76G19 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PDZD4Q76G19 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PDZD4Q76G19 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PDZD4Q76G19 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PDZD4Q76G19 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PDZD4Q76G19 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDZD4Q76G19 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PDZD4Q76G19 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDZD4Q76G19 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PDZD4Q76G19 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDZD4Q76G19 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDZD4Q76G19 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDZD4Q76G19 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDZD4Q76G19 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDZD4Q76G19 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDZD4Q76G19 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PDZD4Q76G19 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDZD4Q76G19 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDZD4Q76G19 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDZD4Q76G19 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDZD4Q76G19 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDZD4Q76G19 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDZD4Q76G19 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDZD4Q76G19 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PDZD4Q76G19 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PDZD4Q76G19 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDZD4Q76G19 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDZD4Q76G19 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDZD4Q76G19 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDZD4Q76G19 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDZD4Q76G19 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PDZD4Q76G19 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PDZD4Q76G19 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PDZD4Q76G19 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PDZD4Q76G19 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PDZD4Q76G19 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PDZD4Q76G19 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PDZD4Q76G19 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDZD4Q76G19 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PDZD4Q76G19 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
PDZD4Q76G19 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDZD4Q76G19 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDZD4Q76G19 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDZD4Q76G19 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDZD4Q76G19 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDZD4Q76G19 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDZD4Q76G19 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDZD4Q76G19 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDZD4Q76G19 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PDZD4Q76G19 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PDZD4Q76G19 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDZD4Q76G19 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDZD4Q76G19 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDZD4Q76G19 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDZD4Q76G19 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDZD4Q76G19 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDZD4Q76G19 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDZD4Q76G19 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDZD4Q76G19 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDZD4Q76G19 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PDZD4Q76G19 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
PDZD4Q76G19 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDZD4Q76G19 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDZD4Q76G19 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDZD4Q76G19 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDZD4Q76G19 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PDZD4Q76G19 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PDZD4Q76G19 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDZD4Q76G19 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDZD4Q76G19 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDZD4Q76G19 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDZD4Q76G19 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDZD4Q76G19 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDZD4Q76G19 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDZD4Q76G19 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PDZD4Q76G19 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDZD4Q76G19 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDZD4Q76G19 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDZD4Q76G19 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDZD4Q76G19 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDZD4Q76G19 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDZD4Q76G19 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDZD4Q76G19 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDZD4Q76G19 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms