Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
FOXD4L3Q6VB84 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
FOXD4L3Q6VB84 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
FOXD4L3Q6VB84 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
FOXD4L3Q6VB84 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
FOXD4L3Q6VB84 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
FOXD4L3Q6VB84 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
FOXD4L3Q6VB84 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
FOXD4L3Q6VB84 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
FOXD4L3Q6VB84 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
FOXD4L3Q6VB84 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
FOXD4L3Q6VB84 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
FOXD4L3Q6VB84 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
FOXD4L3Q6VB84 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
FOXD4L3Q6VB84 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
FOXD4L3Q6VB84 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
FOXD4L3Q6VB84 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
FOXD4L3Q6VB84 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
FOXD4L3Q6VB84 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
FOXD4L3Q6VB84 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
FOXD4L3Q6VB84 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
FOXD4L3Q6VB84 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
FOXD4L3Q6VB84 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
FOXD4L3Q6VB84 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
FOXD4L3Q6VB84 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
FOXD4L3Q6VB84 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
FOXD4L3Q6VB84 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
FOXD4L3Q6VB84 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
FOXD4L3Q6VB84 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
FOXD4L3Q6VB84 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
FOXD4L3Q6VB84 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
FOXD4L3Q6VB84 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
FOXD4L3Q6VB84 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
FOXD4L3Q6VB84 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
FOXD4L3Q6VB84 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
FOXD4L3Q6VB84 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
FOXD4L3Q6VB84 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
FOXD4L3Q6VB84 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
FOXD4L3Q6VB84 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
FOXD4L3Q6VB84 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32■■■□□ 2.71
FOXD4L3Q6VB84 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
FOXD4L3Q6VB84 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
FOXD4L3Q6VB84 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
FOXD4L3Q6VB84 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
FOXD4L3Q6VB84 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
FOXD4L3Q6VB84 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
FOXD4L3Q6VB84 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
FOXD4L3Q6VB84 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
FOXD4L3Q6VB84 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
FOXD4L3Q6VB84 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
FOXD4L3Q6VB84 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
FOXD4L3Q6VB84 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
FOXD4L3Q6VB84 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
FOXD4L3Q6VB84 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
FOXD4L3Q6VB84 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
FOXD4L3Q6VB84 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
FOXD4L3Q6VB84 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
FOXD4L3Q6VB84 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
FOXD4L3Q6VB84 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
FOXD4L3Q6VB84 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
FOXD4L3Q6VB84 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
FOXD4L3Q6VB84 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
FOXD4L3Q6VB84 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
FOXD4L3Q6VB84 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
FOXD4L3Q6VB84 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
FOXD4L3Q6VB84 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
FOXD4L3Q6VB84 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
FOXD4L3Q6VB84 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
FOXD4L3Q6VB84 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
FOXD4L3Q6VB84 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
FOXD4L3Q6VB84 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
FOXD4L3Q6VB84 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
FOXD4L3Q6VB84 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
FOXD4L3Q6VB84 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
FOXD4L3Q6VB84 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
FOXD4L3Q6VB84 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
FOXD4L3Q6VB84 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
FOXD4L3Q6VB84 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
FOXD4L3Q6VB84 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
FOXD4L3Q6VB84 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
FOXD4L3Q6VB84 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
FOXD4L3Q6VB84 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
FOXD4L3Q6VB84 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
FOXD4L3Q6VB84 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
FOXD4L3Q6VB84 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
FOXD4L3Q6VB84 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
FOXD4L3Q6VB84 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
FOXD4L3Q6VB84 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
FOXD4L3Q6VB84 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
FOXD4L3Q6VB84 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
FOXD4L3Q6VB84 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
FOXD4L3Q6VB84 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
FOXD4L3Q6VB84 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
FOXD4L3Q6VB84 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
FOXD4L3Q6VB84 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
FOXD4L3Q6VB84 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
FOXD4L3Q6VB84 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
FOXD4L3Q6VB84 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
FOXD4L3Q6VB84 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
FOXD4L3Q6VB84 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms