Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL4

KLHL24, Kelch-like protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL24Q6TFL4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL24Q6TFL4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL24Q6TFL4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL24Q6TFL4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL24Q6TFL4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL24Q6TFL4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL24Q6TFL4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL24Q6TFL4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL24Q6TFL4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL24Q6TFL4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL24Q6TFL4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL24Q6TFL4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL24Q6TFL4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL24Q6TFL4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL24Q6TFL4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL24Q6TFL4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL24Q6TFL4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL24Q6TFL4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL24Q6TFL4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL24Q6TFL4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL24Q6TFL4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL24Q6TFL4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL24Q6TFL4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL24Q6TFL4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL24Q6TFL4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL24Q6TFL4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL24Q6TFL4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL24Q6TFL4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL24Q6TFL4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL24Q6TFL4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL24Q6TFL4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL24Q6TFL4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL24Q6TFL4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL24Q6TFL4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL24Q6TFL4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL24Q6TFL4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL24Q6TFL4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL24Q6TFL4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL24Q6TFL4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL24Q6TFL4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL24Q6TFL4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL24Q6TFL4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL24Q6TFL4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL24Q6TFL4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL24Q6TFL4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL24Q6TFL4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL24Q6TFL4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL24Q6TFL4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL24Q6TFL4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL24Q6TFL4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL24Q6TFL4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL24Q6TFL4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL24Q6TFL4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL24Q6TFL4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL24Q6TFL4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL24Q6TFL4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL24Q6TFL4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL24Q6TFL4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL24Q6TFL4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL24Q6TFL4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL24Q6TFL4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL24Q6TFL4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL24Q6TFL4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL24Q6TFL4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL24Q6TFL4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL24Q6TFL4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL24Q6TFL4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL24Q6TFL4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL24Q6TFL4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL24Q6TFL4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHL24Q6TFL4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHL24Q6TFL4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL24Q6TFL4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL24Q6TFL4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL24Q6TFL4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL24Q6TFL4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL24Q6TFL4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL24Q6TFL4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL24Q6TFL4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL24Q6TFL4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL24Q6TFL4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL24Q6TFL4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL24Q6TFL4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL24Q6TFL4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KLHL24Q6TFL4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL24Q6TFL4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL24Q6TFL4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL24Q6TFL4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL24Q6TFL4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL24Q6TFL4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL24Q6TFL4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL24Q6TFL4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL24Q6TFL4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL24Q6TFL4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL24Q6TFL4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL24Q6TFL4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL24Q6TFL4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL24Q6TFL4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL24Q6TFL4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL24Q6TFL4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms