Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS38

ALKBH2, DNA oxidative demethylase ALKBH2, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH2Q6NS38 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALKBH2Q6NS38 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALKBH2Q6NS38 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALKBH2Q6NS38 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALKBH2Q6NS38 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALKBH2Q6NS38 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALKBH2Q6NS38 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ALKBH2Q6NS38 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALKBH2Q6NS38 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALKBH2Q6NS38 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALKBH2Q6NS38 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALKBH2Q6NS38 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ALKBH2Q6NS38 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALKBH2Q6NS38 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALKBH2Q6NS38 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALKBH2Q6NS38 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALKBH2Q6NS38 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALKBH2Q6NS38 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALKBH2Q6NS38 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALKBH2Q6NS38 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALKBH2Q6NS38 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALKBH2Q6NS38 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ALKBH2Q6NS38 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALKBH2Q6NS38 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALKBH2Q6NS38 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALKBH2Q6NS38 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALKBH2Q6NS38 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALKBH2Q6NS38 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALKBH2Q6NS38 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALKBH2Q6NS38 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALKBH2Q6NS38 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALKBH2Q6NS38 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALKBH2Q6NS38 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALKBH2Q6NS38 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALKBH2Q6NS38 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALKBH2Q6NS38 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALKBH2Q6NS38 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALKBH2Q6NS38 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALKBH2Q6NS38 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALKBH2Q6NS38 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ALKBH2Q6NS38 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALKBH2Q6NS38 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALKBH2Q6NS38 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALKBH2Q6NS38 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALKBH2Q6NS38 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALKBH2Q6NS38 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALKBH2Q6NS38 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ALKBH2Q6NS38 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALKBH2Q6NS38 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALKBH2Q6NS38 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALKBH2Q6NS38 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALKBH2Q6NS38 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALKBH2Q6NS38 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALKBH2Q6NS38 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ALKBH2Q6NS38 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALKBH2Q6NS38 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALKBH2Q6NS38 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALKBH2Q6NS38 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALKBH2Q6NS38 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALKBH2Q6NS38 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALKBH2Q6NS38 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALKBH2Q6NS38 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALKBH2Q6NS38 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ALKBH2Q6NS38 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALKBH2Q6NS38 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALKBH2Q6NS38 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALKBH2Q6NS38 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALKBH2Q6NS38 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALKBH2Q6NS38 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ALKBH2Q6NS38 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALKBH2Q6NS38 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALKBH2Q6NS38 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALKBH2Q6NS38 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALKBH2Q6NS38 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALKBH2Q6NS38 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALKBH2Q6NS38 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALKBH2Q6NS38 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ALKBH2Q6NS38 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ALKBH2Q6NS38 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ALKBH2Q6NS38 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALKBH2Q6NS38 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALKBH2Q6NS38 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALKBH2Q6NS38 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALKBH2Q6NS38 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALKBH2Q6NS38 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ALKBH2Q6NS38 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ALKBH2Q6NS38 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALKBH2Q6NS38 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALKBH2Q6NS38 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALKBH2Q6NS38 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALKBH2Q6NS38 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALKBH2Q6NS38 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALKBH2Q6NS38 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALKBH2Q6NS38 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALKBH2Q6NS38 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALKBH2Q6NS38 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALKBH2Q6NS38 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALKBH2Q6NS38 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALKBH2Q6NS38 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALKBH2Q6NS38 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms