Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG85

Putative UPF0633 protein LOC554249, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5XG85 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q5XG85 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q5XG85 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q5XG85 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q5XG85 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q5XG85 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q5XG85 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q5XG85 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q5XG85 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Q5XG85 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q5XG85 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q5XG85 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q5XG85 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q5XG85 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q5XG85 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q5XG85 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q5XG85 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q5XG85 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q5XG85 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q5XG85 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q5XG85 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q5XG85 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q5XG85 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q5XG85 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q5XG85 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q5XG85 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q5XG85 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q5XG85 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q5XG85 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q5XG85 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q5XG85 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q5XG85 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q5XG85 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q5XG85 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q5XG85 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q5XG85 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q5XG85 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q5XG85 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q5XG85 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q5XG85 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q5XG85 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q5XG85 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q5XG85 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q5XG85 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q5XG85 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q5XG85 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q5XG85 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q5XG85 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q5XG85 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q5XG85 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q5XG85 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q5XG85 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q5XG85 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q5XG85 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q5XG85 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q5XG85 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q5XG85 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q5XG85 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q5XG85 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q5XG85 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q5XG85 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q5XG85 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q5XG85 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q5XG85 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q5XG85 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q5XG85 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q5XG85 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q5XG85 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q5XG85 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q5XG85 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q5XG85 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q5XG85 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q5XG85 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q5XG85 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q5XG85 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q5XG85 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q5XG85 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q5XG85 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q5XG85 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q5XG85 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q5XG85 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q5XG85 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q5XG85 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q5XG85 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q5XG85 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q5XG85 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q5XG85 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q5XG85 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q5XG85 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q5XG85 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q5XG85 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q5XG85 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q5XG85 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q5XG85 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q5XG85 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q5XG85 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q5XG85 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q5XG85 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q5XG85 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q5XG85 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms