Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHEQ5VZ18 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHEQ5VZ18 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHEQ5VZ18 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHEQ5VZ18 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHEQ5VZ18 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHEQ5VZ18 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHEQ5VZ18 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHEQ5VZ18 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHEQ5VZ18 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHEQ5VZ18 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHEQ5VZ18 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHEQ5VZ18 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHEQ5VZ18 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHEQ5VZ18 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHEQ5VZ18 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHEQ5VZ18 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SHEQ5VZ18 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHEQ5VZ18 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHEQ5VZ18 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHEQ5VZ18 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHEQ5VZ18 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHEQ5VZ18 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHEQ5VZ18 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHEQ5VZ18 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHEQ5VZ18 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHEQ5VZ18 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHEQ5VZ18 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHEQ5VZ18 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHEQ5VZ18 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHEQ5VZ18 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHEQ5VZ18 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHEQ5VZ18 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHEQ5VZ18 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SHEQ5VZ18 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHEQ5VZ18 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHEQ5VZ18 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHEQ5VZ18 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHEQ5VZ18 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHEQ5VZ18 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHEQ5VZ18 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHEQ5VZ18 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHEQ5VZ18 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHEQ5VZ18 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHEQ5VZ18 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SHEQ5VZ18 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHEQ5VZ18 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SHEQ5VZ18 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHEQ5VZ18 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHEQ5VZ18 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHEQ5VZ18 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SHEQ5VZ18 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHEQ5VZ18 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHEQ5VZ18 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHEQ5VZ18 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHEQ5VZ18 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHEQ5VZ18 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHEQ5VZ18 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHEQ5VZ18 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHEQ5VZ18 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHEQ5VZ18 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHEQ5VZ18 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHEQ5VZ18 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHEQ5VZ18 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHEQ5VZ18 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHEQ5VZ18 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHEQ5VZ18 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHEQ5VZ18 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SHEQ5VZ18 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHEQ5VZ18 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SHEQ5VZ18 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHEQ5VZ18 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHEQ5VZ18 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SHEQ5VZ18 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHEQ5VZ18 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHEQ5VZ18 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHEQ5VZ18 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHEQ5VZ18 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHEQ5VZ18 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHEQ5VZ18 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHEQ5VZ18 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHEQ5VZ18 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHEQ5VZ18 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHEQ5VZ18 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHEQ5VZ18 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHEQ5VZ18 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHEQ5VZ18 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SHEQ5VZ18 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHEQ5VZ18 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHEQ5VZ18 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SHEQ5VZ18 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SHEQ5VZ18 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHEQ5VZ18 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHEQ5VZ18 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHEQ5VZ18 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SHEQ5VZ18 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
SHEQ5VZ18 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHEQ5VZ18 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHEQ5VZ18 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHEQ5VZ18 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms