Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4F4

ZFYVE27, Protrudin, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE27Q5T4F4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZFYVE27Q5T4F4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZFYVE27Q5T4F4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZFYVE27Q5T4F4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZFYVE27Q5T4F4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZFYVE27Q5T4F4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZFYVE27Q5T4F4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZFYVE27Q5T4F4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZFYVE27Q5T4F4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZFYVE27Q5T4F4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZFYVE27Q5T4F4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZFYVE27Q5T4F4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZFYVE27Q5T4F4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZFYVE27Q5T4F4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZFYVE27Q5T4F4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZFYVE27Q5T4F4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZFYVE27Q5T4F4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZFYVE27Q5T4F4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZFYVE27Q5T4F4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZFYVE27Q5T4F4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZFYVE27Q5T4F4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ZFYVE27Q5T4F4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZFYVE27Q5T4F4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZFYVE27Q5T4F4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZFYVE27Q5T4F4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZFYVE27Q5T4F4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZFYVE27Q5T4F4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ZFYVE27Q5T4F4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZFYVE27Q5T4F4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZFYVE27Q5T4F4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZFYVE27Q5T4F4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZFYVE27Q5T4F4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZFYVE27Q5T4F4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZFYVE27Q5T4F4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZFYVE27Q5T4F4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZFYVE27Q5T4F4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZFYVE27Q5T4F4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZFYVE27Q5T4F4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZFYVE27Q5T4F4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZFYVE27Q5T4F4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZFYVE27Q5T4F4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZFYVE27Q5T4F4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZFYVE27Q5T4F4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZFYVE27Q5T4F4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZFYVE27Q5T4F4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZFYVE27Q5T4F4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZFYVE27Q5T4F4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZFYVE27Q5T4F4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZFYVE27Q5T4F4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZFYVE27Q5T4F4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ZFYVE27Q5T4F4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZFYVE27Q5T4F4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZFYVE27Q5T4F4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZFYVE27Q5T4F4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZFYVE27Q5T4F4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZFYVE27Q5T4F4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZFYVE27Q5T4F4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZFYVE27Q5T4F4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZFYVE27Q5T4F4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZFYVE27Q5T4F4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZFYVE27Q5T4F4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZFYVE27Q5T4F4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZFYVE27Q5T4F4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZFYVE27Q5T4F4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ZFYVE27Q5T4F4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZFYVE27Q5T4F4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZFYVE27Q5T4F4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZFYVE27Q5T4F4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZFYVE27Q5T4F4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZFYVE27Q5T4F4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZFYVE27Q5T4F4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ZFYVE27Q5T4F4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZFYVE27Q5T4F4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZFYVE27Q5T4F4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZFYVE27Q5T4F4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZFYVE27Q5T4F4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZFYVE27Q5T4F4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZFYVE27Q5T4F4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZFYVE27Q5T4F4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZFYVE27Q5T4F4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZFYVE27Q5T4F4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZFYVE27Q5T4F4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZFYVE27Q5T4F4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZFYVE27Q5T4F4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZFYVE27Q5T4F4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZFYVE27Q5T4F4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZFYVE27Q5T4F4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZFYVE27Q5T4F4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZFYVE27Q5T4F4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZFYVE27Q5T4F4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZFYVE27Q5T4F4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZFYVE27Q5T4F4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZFYVE27Q5T4F4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZFYVE27Q5T4F4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZFYVE27Q5T4F4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZFYVE27Q5T4F4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZFYVE27Q5T4F4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZFYVE27Q5T4F4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms