Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDZK1Q5T2W1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDZK1Q5T2W1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDZK1Q5T2W1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDZK1Q5T2W1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDZK1Q5T2W1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDZK1Q5T2W1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDZK1Q5T2W1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDZK1Q5T2W1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDZK1Q5T2W1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDZK1Q5T2W1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDZK1Q5T2W1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDZK1Q5T2W1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDZK1Q5T2W1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDZK1Q5T2W1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDZK1Q5T2W1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDZK1Q5T2W1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDZK1Q5T2W1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PDZK1Q5T2W1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDZK1Q5T2W1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDZK1Q5T2W1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDZK1Q5T2W1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDZK1Q5T2W1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDZK1Q5T2W1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDZK1Q5T2W1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDZK1Q5T2W1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDZK1Q5T2W1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDZK1Q5T2W1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDZK1Q5T2W1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDZK1Q5T2W1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDZK1Q5T2W1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDZK1Q5T2W1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDZK1Q5T2W1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDZK1Q5T2W1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDZK1Q5T2W1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDZK1Q5T2W1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDZK1Q5T2W1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDZK1Q5T2W1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDZK1Q5T2W1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDZK1Q5T2W1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDZK1Q5T2W1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDZK1Q5T2W1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDZK1Q5T2W1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDZK1Q5T2W1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDZK1Q5T2W1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDZK1Q5T2W1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDZK1Q5T2W1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDZK1Q5T2W1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDZK1Q5T2W1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDZK1Q5T2W1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDZK1Q5T2W1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDZK1Q5T2W1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDZK1Q5T2W1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDZK1Q5T2W1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDZK1Q5T2W1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDZK1Q5T2W1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDZK1Q5T2W1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PDZK1Q5T2W1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDZK1Q5T2W1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDZK1Q5T2W1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDZK1Q5T2W1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDZK1Q5T2W1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDZK1Q5T2W1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDZK1Q5T2W1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDZK1Q5T2W1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDZK1Q5T2W1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDZK1Q5T2W1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDZK1Q5T2W1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDZK1Q5T2W1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDZK1Q5T2W1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDZK1Q5T2W1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDZK1Q5T2W1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDZK1Q5T2W1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDZK1Q5T2W1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDZK1Q5T2W1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDZK1Q5T2W1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDZK1Q5T2W1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDZK1Q5T2W1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDZK1Q5T2W1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDZK1Q5T2W1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDZK1Q5T2W1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PDZK1Q5T2W1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDZK1Q5T2W1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDZK1Q5T2W1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDZK1Q5T2W1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDZK1Q5T2W1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDZK1Q5T2W1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDZK1Q5T2W1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDZK1Q5T2W1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDZK1Q5T2W1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDZK1Q5T2W1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDZK1Q5T2W1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDZK1Q5T2W1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDZK1Q5T2W1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDZK1Q5T2W1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDZK1Q5T2W1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDZK1Q5T2W1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDZK1Q5T2W1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDZK1Q5T2W1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDZK1Q5T2W1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms