Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC43.46■■■■■ 4.55
FRMPD1Q5SYB0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
FRMPD1Q5SYB0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
FRMPD1Q5SYB0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
FRMPD1Q5SYB0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC43.43■■■■■ 4.54
FRMPD1Q5SYB0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC43.41■■■■■ 4.54
FRMPD1Q5SYB0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC43.39■■■■■ 4.54
FRMPD1Q5SYB0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC43.39■■■■■ 4.54
FRMPD1Q5SYB0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.54
FRMPD1Q5SYB0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.38■■■■■ 4.54
FRMPD1Q5SYB0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC43.37■■■■■ 4.53
FRMPD1Q5SYB0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC43.37■■■■■ 4.53
FRMPD1Q5SYB0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC43.36■■■■■ 4.53
FRMPD1Q5SYB0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC43.36■■■■■ 4.53
FRMPD1Q5SYB0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
FRMPD1Q5SYB0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC43.31■■■■■ 4.52
FRMPD1Q5SYB0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC43.3■■■■■ 4.52
FRMPD1Q5SYB0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC43.3■■■■■ 4.52
FRMPD1Q5SYB0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.29■■■■■ 4.52
FRMPD1Q5SYB0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.29■■■■■ 4.52
FRMPD1Q5SYB0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC43.29■■■■■ 4.52
FRMPD1Q5SYB0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC43.29■■■■■ 4.52
FRMPD1Q5SYB0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
FRMPD1Q5SYB0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
FRMPD1Q5SYB0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
FRMPD1Q5SYB0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC43.2■■■■■ 4.51
FRMPD1Q5SYB0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC43.17■■■■■ 4.5
FRMPD1Q5SYB0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC43.15■■■■■ 4.5
FRMPD1Q5SYB0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC43.12■■■■■ 4.49
FRMPD1Q5SYB0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC43.12■■■■■ 4.49
FRMPD1Q5SYB0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
FRMPD1Q5SYB0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
FRMPD1Q5SYB0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.11■■■■■ 4.49
FRMPD1Q5SYB0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.11■■■■■ 4.49
FRMPD1Q5SYB0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC43.08■■■■■ 4.49
FRMPD1Q5SYB0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC43.07■■■■■ 4.48
FRMPD1Q5SYB0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC43.07■■■■■ 4.48
FRMPD1Q5SYB0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.06■■■■■ 4.48
FRMPD1Q5SYB0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.06■■■■■ 4.48
FRMPD1Q5SYB0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.04■■■■■ 4.48
FRMPD1Q5SYB0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC43.03■■■■■ 4.48
FRMPD1Q5SYB0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC43.02■■■■■ 4.48
FRMPD1Q5SYB0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
FRMPD1Q5SYB0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.97■■■■■ 4.47
FRMPD1Q5SYB0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC42.97■■■■■ 4.47
FRMPD1Q5SYB0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
FRMPD1Q5SYB0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
FRMPD1Q5SYB0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
FRMPD1Q5SYB0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC42.9■■■■■ 4.46
FRMPD1Q5SYB0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
FRMPD1Q5SYB0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC42.87■■■■■ 4.45
FRMPD1Q5SYB0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
FRMPD1Q5SYB0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC42.85■■■■■ 4.45
FRMPD1Q5SYB0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
FRMPD1Q5SYB0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC42.83■■■■■ 4.45
FRMPD1Q5SYB0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC42.83■■■■■ 4.45
FRMPD1Q5SYB0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC42.78■■■■■ 4.44
FRMPD1Q5SYB0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC42.78■■■■■ 4.44
FRMPD1Q5SYB0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
FRMPD1Q5SYB0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
FRMPD1Q5SYB0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC42.73■■■■■ 4.43
FRMPD1Q5SYB0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC42.73■■■■■ 4.43
FRMPD1Q5SYB0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
FRMPD1Q5SYB0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC42.69■■■■■ 4.43
FRMPD1Q5SYB0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC42.68■■■■■ 4.42
FRMPD1Q5SYB0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC42.68■■■■■ 4.42
FRMPD1Q5SYB0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC42.67■■■■■ 4.42
FRMPD1Q5SYB0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC42.67■■■■■ 4.42
FRMPD1Q5SYB0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
FRMPD1Q5SYB0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC42.64■■■■■ 4.42
FRMPD1Q5SYB0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC42.63■■■■■ 4.41
FRMPD1Q5SYB0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
FRMPD1Q5SYB0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
FRMPD1Q5SYB0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
FRMPD1Q5SYB0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
FRMPD1Q5SYB0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC42.58■■■■■ 4.41
FRMPD1Q5SYB0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
FRMPD1Q5SYB0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC42.56■■■■■ 4.4
FRMPD1Q5SYB0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
FRMPD1Q5SYB0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC42.54■■■■■ 4.4
FRMPD1Q5SYB0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
FRMPD1Q5SYB0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
FRMPD1Q5SYB0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.52■■■■■ 4.4
FRMPD1Q5SYB0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
FRMPD1Q5SYB0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
FRMPD1Q5SYB0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC42.51■■■■■ 4.4
FRMPD1Q5SYB0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.5■■■■■ 4.39
FRMPD1Q5SYB0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.5■■■■■ 4.39
FRMPD1Q5SYB0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC42.49■■■■■ 4.39
FRMPD1Q5SYB0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
FRMPD1Q5SYB0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC42.48■■■■■ 4.39
FRMPD1Q5SYB0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.46■■■■■ 4.39
FRMPD1Q5SYB0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC42.44■■■■■ 4.39
FRMPD1Q5SYB0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC42.39■■■■■ 4.38
FRMPD1Q5SYB0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC42.39■■■■■ 4.38
FRMPD1Q5SYB0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
FRMPD1Q5SYB0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
FRMPD1Q5SYB0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC42.38■■■■■ 4.37
FRMPD1Q5SYB0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC42.37■■■■■ 4.37
FRMPD1Q5SYB0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms