Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ODF2Q5BJF6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ODF2Q5BJF6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ODF2Q5BJF6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ODF2Q5BJF6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ODF2Q5BJF6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ODF2Q5BJF6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ODF2Q5BJF6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ODF2Q5BJF6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ODF2Q5BJF6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ODF2Q5BJF6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ODF2Q5BJF6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ODF2Q5BJF6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ODF2Q5BJF6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ODF2Q5BJF6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ODF2Q5BJF6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ODF2Q5BJF6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ODF2Q5BJF6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ODF2Q5BJF6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ODF2Q5BJF6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ODF2Q5BJF6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ODF2Q5BJF6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ODF2Q5BJF6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ODF2Q5BJF6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ODF2Q5BJF6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ODF2Q5BJF6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ODF2Q5BJF6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ODF2Q5BJF6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ODF2Q5BJF6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ODF2Q5BJF6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ODF2Q5BJF6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ODF2Q5BJF6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ODF2Q5BJF6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ODF2Q5BJF6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ODF2Q5BJF6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ODF2Q5BJF6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ODF2Q5BJF6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ODF2Q5BJF6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ODF2Q5BJF6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
ODF2Q5BJF6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ODF2Q5BJF6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ODF2Q5BJF6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ODF2Q5BJF6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ODF2Q5BJF6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ODF2Q5BJF6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ODF2Q5BJF6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ODF2Q5BJF6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ODF2Q5BJF6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ODF2Q5BJF6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ODF2Q5BJF6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ODF2Q5BJF6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ODF2Q5BJF6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ODF2Q5BJF6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ODF2Q5BJF6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ODF2Q5BJF6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ODF2Q5BJF6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ODF2Q5BJF6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ODF2Q5BJF6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ODF2Q5BJF6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ODF2Q5BJF6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ODF2Q5BJF6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ODF2Q5BJF6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ODF2Q5BJF6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ODF2Q5BJF6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ODF2Q5BJF6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ODF2Q5BJF6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ODF2Q5BJF6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ODF2Q5BJF6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ODF2Q5BJF6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ODF2Q5BJF6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ODF2Q5BJF6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ODF2Q5BJF6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ODF2Q5BJF6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ODF2Q5BJF6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ODF2Q5BJF6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ODF2Q5BJF6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ODF2Q5BJF6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ODF2Q5BJF6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ODF2Q5BJF6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ODF2Q5BJF6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ODF2Q5BJF6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ODF2Q5BJF6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
ODF2Q5BJF6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
ODF2Q5BJF6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ODF2Q5BJF6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ODF2Q5BJF6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ODF2Q5BJF6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ODF2Q5BJF6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ODF2Q5BJF6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ODF2Q5BJF6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ODF2Q5BJF6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ODF2Q5BJF6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ODF2Q5BJF6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ODF2Q5BJF6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ODF2Q5BJF6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ODF2Q5BJF6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ODF2Q5BJF6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ODF2Q5BJF6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ODF2Q5BJF6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
ODF2Q5BJF6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms