Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXF1

FAM74A3, Putative protein FAM74A3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM74A3Q4VXF1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM74A3Q4VXF1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM74A3Q4VXF1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM74A3Q4VXF1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM74A3Q4VXF1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM74A3Q4VXF1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM74A3Q4VXF1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM74A3Q4VXF1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM74A3Q4VXF1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM74A3Q4VXF1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM74A3Q4VXF1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM74A3Q4VXF1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM74A3Q4VXF1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM74A3Q4VXF1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM74A3Q4VXF1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM74A3Q4VXF1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM74A3Q4VXF1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM74A3Q4VXF1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM74A3Q4VXF1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM74A3Q4VXF1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM74A3Q4VXF1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM74A3Q4VXF1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM74A3Q4VXF1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM74A3Q4VXF1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM74A3Q4VXF1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM74A3Q4VXF1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM74A3Q4VXF1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM74A3Q4VXF1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM74A3Q4VXF1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM74A3Q4VXF1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM74A3Q4VXF1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM74A3Q4VXF1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM74A3Q4VXF1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM74A3Q4VXF1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM74A3Q4VXF1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM74A3Q4VXF1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM74A3Q4VXF1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FAM74A3Q4VXF1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM74A3Q4VXF1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM74A3Q4VXF1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM74A3Q4VXF1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM74A3Q4VXF1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM74A3Q4VXF1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM74A3Q4VXF1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM74A3Q4VXF1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM74A3Q4VXF1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM74A3Q4VXF1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM74A3Q4VXF1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM74A3Q4VXF1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM74A3Q4VXF1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM74A3Q4VXF1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM74A3Q4VXF1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM74A3Q4VXF1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM74A3Q4VXF1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM74A3Q4VXF1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM74A3Q4VXF1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM74A3Q4VXF1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM74A3Q4VXF1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM74A3Q4VXF1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM74A3Q4VXF1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM74A3Q4VXF1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM74A3Q4VXF1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM74A3Q4VXF1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM74A3Q4VXF1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM74A3Q4VXF1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM74A3Q4VXF1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM74A3Q4VXF1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM74A3Q4VXF1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM74A3Q4VXF1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM74A3Q4VXF1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM74A3Q4VXF1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM74A3Q4VXF1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM74A3Q4VXF1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM74A3Q4VXF1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM74A3Q4VXF1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM74A3Q4VXF1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM74A3Q4VXF1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM74A3Q4VXF1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM74A3Q4VXF1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM74A3Q4VXF1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM74A3Q4VXF1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM74A3Q4VXF1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM74A3Q4VXF1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM74A3Q4VXF1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM74A3Q4VXF1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM74A3Q4VXF1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM74A3Q4VXF1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM74A3Q4VXF1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM74A3Q4VXF1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM74A3Q4VXF1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM74A3Q4VXF1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM74A3Q4VXF1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM74A3Q4VXF1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM74A3Q4VXF1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM74A3Q4VXF1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM74A3Q4VXF1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM74A3Q4VXF1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM74A3Q4VXF1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM74A3Q4VXF1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM74A3Q4VXF1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms