Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TPRNQ4KMQ1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TPRNQ4KMQ1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TPRNQ4KMQ1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TPRNQ4KMQ1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TPRNQ4KMQ1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TPRNQ4KMQ1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TPRNQ4KMQ1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TPRNQ4KMQ1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TPRNQ4KMQ1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TPRNQ4KMQ1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TPRNQ4KMQ1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TPRNQ4KMQ1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TPRNQ4KMQ1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TPRNQ4KMQ1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
TPRNQ4KMQ1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
TPRNQ4KMQ1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TPRNQ4KMQ1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
TPRNQ4KMQ1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TPRNQ4KMQ1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TPRNQ4KMQ1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TPRNQ4KMQ1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TPRNQ4KMQ1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TPRNQ4KMQ1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TPRNQ4KMQ1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TPRNQ4KMQ1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TPRNQ4KMQ1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
TPRNQ4KMQ1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
TPRNQ4KMQ1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
TPRNQ4KMQ1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TPRNQ4KMQ1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TPRNQ4KMQ1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TPRNQ4KMQ1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TPRNQ4KMQ1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TPRNQ4KMQ1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
TPRNQ4KMQ1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TPRNQ4KMQ1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
TPRNQ4KMQ1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TPRNQ4KMQ1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TPRNQ4KMQ1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
TPRNQ4KMQ1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
TPRNQ4KMQ1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.87■■■□□ 2.69
TPRNQ4KMQ1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TPRNQ4KMQ1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TPRNQ4KMQ1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TPRNQ4KMQ1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
TPRNQ4KMQ1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TPRNQ4KMQ1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TPRNQ4KMQ1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TPRNQ4KMQ1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
TPRNQ4KMQ1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
TPRNQ4KMQ1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
TPRNQ4KMQ1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
TPRNQ4KMQ1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TPRNQ4KMQ1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TPRNQ4KMQ1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TPRNQ4KMQ1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TPRNQ4KMQ1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TPRNQ4KMQ1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
TPRNQ4KMQ1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TPRNQ4KMQ1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TPRNQ4KMQ1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
TPRNQ4KMQ1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TPRNQ4KMQ1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TPRNQ4KMQ1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TPRNQ4KMQ1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TPRNQ4KMQ1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TPRNQ4KMQ1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
TPRNQ4KMQ1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TPRNQ4KMQ1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
TPRNQ4KMQ1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TPRNQ4KMQ1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TPRNQ4KMQ1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TPRNQ4KMQ1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TPRNQ4KMQ1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TPRNQ4KMQ1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TPRNQ4KMQ1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TPRNQ4KMQ1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TPRNQ4KMQ1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
TPRNQ4KMQ1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TPRNQ4KMQ1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TPRNQ4KMQ1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
TPRNQ4KMQ1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TPRNQ4KMQ1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TPRNQ4KMQ1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TPRNQ4KMQ1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TPRNQ4KMQ1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TPRNQ4KMQ1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TPRNQ4KMQ1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TPRNQ4KMQ1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TPRNQ4KMQ1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TPRNQ4KMQ1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TPRNQ4KMQ1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TPRNQ4KMQ1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TPRNQ4KMQ1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TPRNQ4KMQ1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TPRNQ4KMQ1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TPRNQ4KMQ1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
TPRNQ4KMQ1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TPRNQ4KMQ1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
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