Protein–RNA interactions for Protein: Q49B96

COX19, Cytochrome c oxidase assembly protein COX19, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX19Q49B96 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COX19Q49B96 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COX19Q49B96 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COX19Q49B96 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COX19Q49B96 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COX19Q49B96 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COX19Q49B96 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COX19Q49B96 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COX19Q49B96 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COX19Q49B96 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21■□□□□ 0.95
COX19Q49B96 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COX19Q49B96 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
COX19Q49B96 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COX19Q49B96 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COX19Q49B96 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COX19Q49B96 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COX19Q49B96 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
COX19Q49B96 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COX19Q49B96 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COX19Q49B96 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COX19Q49B96 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COX19Q49B96 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COX19Q49B96 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COX19Q49B96 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COX19Q49B96 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COX19Q49B96 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COX19Q49B96 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COX19Q49B96 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COX19Q49B96 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
COX19Q49B96 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COX19Q49B96 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COX19Q49B96 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COX19Q49B96 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COX19Q49B96 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COX19Q49B96 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COX19Q49B96 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COX19Q49B96 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COX19Q49B96 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COX19Q49B96 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COX19Q49B96 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COX19Q49B96 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COX19Q49B96 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COX19Q49B96 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
COX19Q49B96 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
COX19Q49B96 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COX19Q49B96 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COX19Q49B96 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COX19Q49B96 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COX19Q49B96 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COX19Q49B96 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COX19Q49B96 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COX19Q49B96 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COX19Q49B96 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COX19Q49B96 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COX19Q49B96 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COX19Q49B96 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COX19Q49B96 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COX19Q49B96 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COX19Q49B96 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COX19Q49B96 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COX19Q49B96 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COX19Q49B96 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COX19Q49B96 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COX19Q49B96 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
COX19Q49B96 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
COX19Q49B96 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COX19Q49B96 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COX19Q49B96 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COX19Q49B96 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COX19Q49B96 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COX19Q49B96 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COX19Q49B96 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COX19Q49B96 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COX19Q49B96 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COX19Q49B96 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COX19Q49B96 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COX19Q49B96 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COX19Q49B96 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
COX19Q49B96 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COX19Q49B96 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COX19Q49B96 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COX19Q49B96 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COX19Q49B96 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COX19Q49B96 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COX19Q49B96 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COX19Q49B96 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COX19Q49B96 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COX19Q49B96 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COX19Q49B96 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COX19Q49B96 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COX19Q49B96 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COX19Q49B96 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COX19Q49B96 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COX19Q49B96 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COX19Q49B96 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COX19Q49B96 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COX19Q49B96 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COX19Q49B96 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COX19Q49B96 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COX19Q49B96 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms