Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7S5

SMIM21, Small integral membrane protein 21, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM21Q3B7S5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMIM21Q3B7S5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMIM21Q3B7S5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMIM21Q3B7S5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM21Q3B7S5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM21Q3B7S5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM21Q3B7S5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMIM21Q3B7S5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMIM21Q3B7S5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMIM21Q3B7S5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM21Q3B7S5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM21Q3B7S5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM21Q3B7S5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM21Q3B7S5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM21Q3B7S5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM21Q3B7S5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM21Q3B7S5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM21Q3B7S5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMIM21Q3B7S5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMIM21Q3B7S5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMIM21Q3B7S5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMIM21Q3B7S5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMIM21Q3B7S5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMIM21Q3B7S5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMIM21Q3B7S5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMIM21Q3B7S5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMIM21Q3B7S5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMIM21Q3B7S5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMIM21Q3B7S5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMIM21Q3B7S5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMIM21Q3B7S5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMIM21Q3B7S5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMIM21Q3B7S5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMIM21Q3B7S5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMIM21Q3B7S5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMIM21Q3B7S5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM21Q3B7S5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM21Q3B7S5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMIM21Q3B7S5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMIM21Q3B7S5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMIM21Q3B7S5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMIM21Q3B7S5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMIM21Q3B7S5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMIM21Q3B7S5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMIM21Q3B7S5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMIM21Q3B7S5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMIM21Q3B7S5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMIM21Q3B7S5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMIM21Q3B7S5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMIM21Q3B7S5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMIM21Q3B7S5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMIM21Q3B7S5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMIM21Q3B7S5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMIM21Q3B7S5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SMIM21Q3B7S5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMIM21Q3B7S5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMIM21Q3B7S5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMIM21Q3B7S5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMIM21Q3B7S5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMIM21Q3B7S5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMIM21Q3B7S5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMIM21Q3B7S5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMIM21Q3B7S5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMIM21Q3B7S5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMIM21Q3B7S5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMIM21Q3B7S5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMIM21Q3B7S5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM21Q3B7S5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM21Q3B7S5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM21Q3B7S5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM21Q3B7S5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM21Q3B7S5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM21Q3B7S5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM21Q3B7S5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM21Q3B7S5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM21Q3B7S5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM21Q3B7S5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMIM21Q3B7S5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMIM21Q3B7S5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM21Q3B7S5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM21Q3B7S5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM21Q3B7S5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMIM21Q3B7S5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMIM21Q3B7S5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMIM21Q3B7S5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMIM21Q3B7S5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM21Q3B7S5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM21Q3B7S5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMIM21Q3B7S5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMIM21Q3B7S5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMIM21Q3B7S5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SMIM21Q3B7S5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMIM21Q3B7S5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM21Q3B7S5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM21Q3B7S5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMIM21Q3B7S5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM21Q3B7S5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM21Q3B7S5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM21Q3B7S5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM21Q3B7S5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms