Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KLHL38Q2WGJ6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KLHL38Q2WGJ6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KLHL38Q2WGJ6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KLHL38Q2WGJ6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KLHL38Q2WGJ6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KLHL38Q2WGJ6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KLHL38Q2WGJ6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KLHL38Q2WGJ6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KLHL38Q2WGJ6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KLHL38Q2WGJ6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KLHL38Q2WGJ6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KLHL38Q2WGJ6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KLHL38Q2WGJ6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KLHL38Q2WGJ6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KLHL38Q2WGJ6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KLHL38Q2WGJ6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KLHL38Q2WGJ6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KLHL38Q2WGJ6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KLHL38Q2WGJ6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KLHL38Q2WGJ6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KLHL38Q2WGJ6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KLHL38Q2WGJ6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KLHL38Q2WGJ6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KLHL38Q2WGJ6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KLHL38Q2WGJ6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KLHL38Q2WGJ6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KLHL38Q2WGJ6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KLHL38Q2WGJ6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KLHL38Q2WGJ6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KLHL38Q2WGJ6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KLHL38Q2WGJ6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KLHL38Q2WGJ6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
KLHL38Q2WGJ6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KLHL38Q2WGJ6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KLHL38Q2WGJ6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KLHL38Q2WGJ6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
KLHL38Q2WGJ6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KLHL38Q2WGJ6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KLHL38Q2WGJ6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KLHL38Q2WGJ6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KLHL38Q2WGJ6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KLHL38Q2WGJ6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KLHL38Q2WGJ6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KLHL38Q2WGJ6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KLHL38Q2WGJ6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KLHL38Q2WGJ6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KLHL38Q2WGJ6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KLHL38Q2WGJ6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KLHL38Q2WGJ6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KLHL38Q2WGJ6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KLHL38Q2WGJ6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KLHL38Q2WGJ6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KLHL38Q2WGJ6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
KLHL38Q2WGJ6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KLHL38Q2WGJ6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KLHL38Q2WGJ6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KLHL38Q2WGJ6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KLHL38Q2WGJ6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KLHL38Q2WGJ6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KLHL38Q2WGJ6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KLHL38Q2WGJ6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
KLHL38Q2WGJ6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KLHL38Q2WGJ6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KLHL38Q2WGJ6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KLHL38Q2WGJ6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KLHL38Q2WGJ6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KLHL38Q2WGJ6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KLHL38Q2WGJ6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KLHL38Q2WGJ6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
KLHL38Q2WGJ6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
KLHL38Q2WGJ6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KLHL38Q2WGJ6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KLHL38Q2WGJ6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KLHL38Q2WGJ6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KLHL38Q2WGJ6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KLHL38Q2WGJ6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KLHL38Q2WGJ6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KLHL38Q2WGJ6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
KLHL38Q2WGJ6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KLHL38Q2WGJ6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KLHL38Q2WGJ6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KLHL38Q2WGJ6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KLHL38Q2WGJ6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KLHL38Q2WGJ6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KLHL38Q2WGJ6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KLHL38Q2WGJ6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KLHL38Q2WGJ6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KLHL38Q2WGJ6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KLHL38Q2WGJ6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KLHL38Q2WGJ6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KLHL38Q2WGJ6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KLHL38Q2WGJ6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KLHL38Q2WGJ6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KLHL38Q2WGJ6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KLHL38Q2WGJ6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KLHL38Q2WGJ6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KLHL38Q2WGJ6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KLHL38Q2WGJ6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
KLHL38Q2WGJ6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms