Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
AP5B1Q2VPB7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
AP5B1Q2VPB7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
AP5B1Q2VPB7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
AP5B1Q2VPB7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
AP5B1Q2VPB7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
AP5B1Q2VPB7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
AP5B1Q2VPB7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
AP5B1Q2VPB7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
AP5B1Q2VPB7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
AP5B1Q2VPB7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
AP5B1Q2VPB7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
AP5B1Q2VPB7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
AP5B1Q2VPB7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
AP5B1Q2VPB7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AP5B1Q2VPB7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
AP5B1Q2VPB7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
AP5B1Q2VPB7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
AP5B1Q2VPB7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
AP5B1Q2VPB7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
AP5B1Q2VPB7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
AP5B1Q2VPB7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
AP5B1Q2VPB7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
AP5B1Q2VPB7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
AP5B1Q2VPB7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
AP5B1Q2VPB7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
AP5B1Q2VPB7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
AP5B1Q2VPB7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AP5B1Q2VPB7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AP5B1Q2VPB7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
AP5B1Q2VPB7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
AP5B1Q2VPB7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
AP5B1Q2VPB7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
AP5B1Q2VPB7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AP5B1Q2VPB7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
AP5B1Q2VPB7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
AP5B1Q2VPB7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
AP5B1Q2VPB7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AP5B1Q2VPB7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AP5B1Q2VPB7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AP5B1Q2VPB7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AP5B1Q2VPB7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AP5B1Q2VPB7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
AP5B1Q2VPB7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
AP5B1Q2VPB7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AP5B1Q2VPB7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AP5B1Q2VPB7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AP5B1Q2VPB7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AP5B1Q2VPB7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AP5B1Q2VPB7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AP5B1Q2VPB7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AP5B1Q2VPB7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AP5B1Q2VPB7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
AP5B1Q2VPB7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AP5B1Q2VPB7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AP5B1Q2VPB7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AP5B1Q2VPB7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AP5B1Q2VPB7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AP5B1Q2VPB7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
AP5B1Q2VPB7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
AP5B1Q2VPB7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
AP5B1Q2VPB7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
AP5B1Q2VPB7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
AP5B1Q2VPB7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
AP5B1Q2VPB7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AP5B1Q2VPB7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AP5B1Q2VPB7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
AP5B1Q2VPB7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AP5B1Q2VPB7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AP5B1Q2VPB7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AP5B1Q2VPB7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AP5B1Q2VPB7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
AP5B1Q2VPB7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
AP5B1Q2VPB7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AP5B1Q2VPB7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
AP5B1Q2VPB7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AP5B1Q2VPB7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
AP5B1Q2VPB7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
AP5B1Q2VPB7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
AP5B1Q2VPB7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
AP5B1Q2VPB7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
AP5B1Q2VPB7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
AP5B1Q2VPB7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
AP5B1Q2VPB7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
AP5B1Q2VPB7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
AP5B1Q2VPB7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AP5B1Q2VPB7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AP5B1Q2VPB7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
AP5B1Q2VPB7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AP5B1Q2VPB7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AP5B1Q2VPB7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
AP5B1Q2VPB7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AP5B1Q2VPB7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AP5B1Q2VPB7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AP5B1Q2VPB7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
AP5B1Q2VPB7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
AP5B1Q2VPB7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AP5B1Q2VPB7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
AP5B1Q2VPB7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
AP5B1Q2VPB7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms