Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHT4

GSG1, Germ cell-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSG1Q2KHT4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GSG1Q2KHT4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GSG1Q2KHT4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GSG1Q2KHT4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GSG1Q2KHT4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GSG1Q2KHT4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GSG1Q2KHT4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GSG1Q2KHT4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GSG1Q2KHT4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GSG1Q2KHT4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GSG1Q2KHT4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GSG1Q2KHT4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GSG1Q2KHT4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GSG1Q2KHT4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GSG1Q2KHT4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GSG1Q2KHT4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GSG1Q2KHT4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSG1Q2KHT4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSG1Q2KHT4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSG1Q2KHT4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSG1Q2KHT4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSG1Q2KHT4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSG1Q2KHT4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSG1Q2KHT4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSG1Q2KHT4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSG1Q2KHT4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSG1Q2KHT4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSG1Q2KHT4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSG1Q2KHT4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSG1Q2KHT4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSG1Q2KHT4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSG1Q2KHT4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSG1Q2KHT4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSG1Q2KHT4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GSG1Q2KHT4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GSG1Q2KHT4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GSG1Q2KHT4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GSG1Q2KHT4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GSG1Q2KHT4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GSG1Q2KHT4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GSG1Q2KHT4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GSG1Q2KHT4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GSG1Q2KHT4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GSG1Q2KHT4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GSG1Q2KHT4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSG1Q2KHT4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSG1Q2KHT4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GSG1Q2KHT4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GSG1Q2KHT4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GSG1Q2KHT4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GSG1Q2KHT4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GSG1Q2KHT4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSG1Q2KHT4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GSG1Q2KHT4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GSG1Q2KHT4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GSG1Q2KHT4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GSG1Q2KHT4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GSG1Q2KHT4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GSG1Q2KHT4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSG1Q2KHT4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSG1Q2KHT4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSG1Q2KHT4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSG1Q2KHT4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GSG1Q2KHT4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GSG1Q2KHT4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GSG1Q2KHT4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSG1Q2KHT4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSG1Q2KHT4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GSG1Q2KHT4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GSG1Q2KHT4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GSG1Q2KHT4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GSG1Q2KHT4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GSG1Q2KHT4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GSG1Q2KHT4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GSG1Q2KHT4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GSG1Q2KHT4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GSG1Q2KHT4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GSG1Q2KHT4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GSG1Q2KHT4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GSG1Q2KHT4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GSG1Q2KHT4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GSG1Q2KHT4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GSG1Q2KHT4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GSG1Q2KHT4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GSG1Q2KHT4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GSG1Q2KHT4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GSG1Q2KHT4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GSG1Q2KHT4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GSG1Q2KHT4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GSG1Q2KHT4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GSG1Q2KHT4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GSG1Q2KHT4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GSG1Q2KHT4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GSG1Q2KHT4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GSG1Q2KHT4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GSG1Q2KHT4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GSG1Q2KHT4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GSG1Q2KHT4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GSG1Q2KHT4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GSG1Q2KHT4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms