Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDK4Q16654 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDK4Q16654 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDK4Q16654 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDK4Q16654 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDK4Q16654 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PDK4Q16654 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDK4Q16654 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDK4Q16654 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDK4Q16654 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDK4Q16654 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDK4Q16654 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDK4Q16654 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDK4Q16654 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDK4Q16654 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDK4Q16654 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDK4Q16654 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDK4Q16654 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDK4Q16654 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDK4Q16654 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDK4Q16654 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDK4Q16654 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDK4Q16654 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDK4Q16654 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDK4Q16654 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDK4Q16654 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDK4Q16654 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PDK4Q16654 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDK4Q16654 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PDK4Q16654 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDK4Q16654 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDK4Q16654 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDK4Q16654 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDK4Q16654 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDK4Q16654 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDK4Q16654 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDK4Q16654 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDK4Q16654 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDK4Q16654 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDK4Q16654 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDK4Q16654 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDK4Q16654 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDK4Q16654 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDK4Q16654 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDK4Q16654 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PDK4Q16654 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDK4Q16654 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDK4Q16654 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDK4Q16654 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PDK4Q16654 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PDK4Q16654 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDK4Q16654 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDK4Q16654 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PDK4Q16654 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDK4Q16654 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PDK4Q16654 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PDK4Q16654 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDK4Q16654 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDK4Q16654 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDK4Q16654 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PDK4Q16654 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDK4Q16654 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDK4Q16654 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDK4Q16654 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDK4Q16654 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PDK4Q16654 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDK4Q16654 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDK4Q16654 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDK4Q16654 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDK4Q16654 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDK4Q16654 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDK4Q16654 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDK4Q16654 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDK4Q16654 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDK4Q16654 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDK4Q16654 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDK4Q16654 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDK4Q16654 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDK4Q16654 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDK4Q16654 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDK4Q16654 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDK4Q16654 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDK4Q16654 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDK4Q16654 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDK4Q16654 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDK4Q16654 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDK4Q16654 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDK4Q16654 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDK4Q16654 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDK4Q16654 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDK4Q16654 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDK4Q16654 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDK4Q16654 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDK4Q16654 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDK4Q16654 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDK4Q16654 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDK4Q16654 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDK4Q16654 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDK4Q16654 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDK4Q16654 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
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