Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACKR1Q16570 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACKR1Q16570 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACKR1Q16570 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACKR1Q16570 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACKR1Q16570 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACKR1Q16570 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACKR1Q16570 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACKR1Q16570 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACKR1Q16570 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACKR1Q16570 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACKR1Q16570 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ACKR1Q16570 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACKR1Q16570 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACKR1Q16570 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACKR1Q16570 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACKR1Q16570 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACKR1Q16570 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACKR1Q16570 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACKR1Q16570 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACKR1Q16570 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACKR1Q16570 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACKR1Q16570 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACKR1Q16570 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACKR1Q16570 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACKR1Q16570 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACKR1Q16570 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACKR1Q16570 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACKR1Q16570 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ACKR1Q16570 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ACKR1Q16570 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACKR1Q16570 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACKR1Q16570 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACKR1Q16570 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACKR1Q16570 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACKR1Q16570 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ACKR1Q16570 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACKR1Q16570 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACKR1Q16570 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACKR1Q16570 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACKR1Q16570 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACKR1Q16570 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACKR1Q16570 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACKR1Q16570 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACKR1Q16570 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACKR1Q16570 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACKR1Q16570 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACKR1Q16570 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACKR1Q16570 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACKR1Q16570 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACKR1Q16570 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACKR1Q16570 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACKR1Q16570 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACKR1Q16570 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACKR1Q16570 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACKR1Q16570 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACKR1Q16570 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACKR1Q16570 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACKR1Q16570 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACKR1Q16570 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACKR1Q16570 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACKR1Q16570 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACKR1Q16570 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACKR1Q16570 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACKR1Q16570 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACKR1Q16570 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACKR1Q16570 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACKR1Q16570 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACKR1Q16570 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACKR1Q16570 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACKR1Q16570 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACKR1Q16570 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACKR1Q16570 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACKR1Q16570 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACKR1Q16570 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACKR1Q16570 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACKR1Q16570 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACKR1Q16570 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACKR1Q16570 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACKR1Q16570 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACKR1Q16570 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACKR1Q16570 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACKR1Q16570 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ACKR1Q16570 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ACKR1Q16570 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACKR1Q16570 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACKR1Q16570 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACKR1Q16570 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACKR1Q16570 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACKR1Q16570 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACKR1Q16570 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACKR1Q16570 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACKR1Q16570 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ACKR1Q16570 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACKR1Q16570 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACKR1Q16570 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACKR1Q16570 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACKR1Q16570 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACKR1Q16570 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACKR1Q16570 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms