Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
NCOA1Q15788 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
NCOA1Q15788 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.38■■■■■ 4.38
NCOA1Q15788 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC42.38■■■■■ 4.38
NCOA1Q15788 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
NCOA1Q15788 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
NCOA1Q15788 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
NCOA1Q15788 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.36
NCOA1Q15788 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
NCOA1Q15788 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
NCOA1Q15788 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
NCOA1Q15788 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
NCOA1Q15788 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC42.27■■■■■ 4.36
NCOA1Q15788 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC42.25■■■■■ 4.35
NCOA1Q15788 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC42.25■■■■■ 4.35
NCOA1Q15788 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC42.25■■■■■ 4.35
NCOA1Q15788 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.24■■■■■ 4.35
NCOA1Q15788 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC42.24■■■■■ 4.35
NCOA1Q15788 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC42.24■■■■■ 4.35
NCOA1Q15788 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC42.21■■■■■ 4.35
NCOA1Q15788 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
NCOA1Q15788 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC42.21■■■■■ 4.35
NCOA1Q15788 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
NCOA1Q15788 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
NCOA1Q15788 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.19■■■■■ 4.34
NCOA1Q15788 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC42.17■■■■■ 4.34
NCOA1Q15788 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC42.14■■■■■ 4.34
NCOA1Q15788 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
NCOA1Q15788 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
NCOA1Q15788 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.1■■■■■ 4.33
NCOA1Q15788 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.1■■■■■ 4.33
NCOA1Q15788 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC42.08■■■■■ 4.33
NCOA1Q15788 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC42.08■■■■■ 4.33
NCOA1Q15788 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
NCOA1Q15788 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
NCOA1Q15788 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
NCOA1Q15788 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
NCOA1Q15788 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
NCOA1Q15788 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
NCOA1Q15788 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
NCOA1Q15788 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
NCOA1Q15788 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC41.98■■■■■ 4.31
NCOA1Q15788 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC41.97■■■■■ 4.31
NCOA1Q15788 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC41.96■■■■■ 4.31
NCOA1Q15788 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
NCOA1Q15788 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
NCOA1Q15788 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC41.95■■■■■ 4.31
NCOA1Q15788 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC41.92■■■■■ 4.3
NCOA1Q15788 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC41.89■■■■■ 4.3
NCOA1Q15788 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
NCOA1Q15788 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
NCOA1Q15788 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC41.86■■■■■ 4.29
NCOA1Q15788 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.86■■■■■ 4.29
NCOA1Q15788 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC41.86■■■■■ 4.29
NCOA1Q15788 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC41.85■■■■■ 4.29
NCOA1Q15788 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
NCOA1Q15788 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
NCOA1Q15788 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
NCOA1Q15788 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
NCOA1Q15788 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.8■■■■■ 4.28
NCOA1Q15788 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
NCOA1Q15788 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC41.78■■■■■ 4.28
NCOA1Q15788 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC41.78■■■■■ 4.28
NCOA1Q15788 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC41.76■■■■■ 4.28
NCOA1Q15788 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.28
NCOA1Q15788 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.75■■■■■ 4.27
NCOA1Q15788 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC41.69■■■■■ 4.26
NCOA1Q15788 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
NCOA1Q15788 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
NCOA1Q15788 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.64■■■■■ 4.26
NCOA1Q15788 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
NCOA1Q15788 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC41.61■■■■■ 4.25
NCOA1Q15788 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC41.6■■■■■ 4.25
NCOA1Q15788 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
NCOA1Q15788 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
NCOA1Q15788 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC41.57■■■■■ 4.25
NCOA1Q15788 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC41.57■■■■■ 4.25
NCOA1Q15788 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC41.54■■■■■ 4.24
NCOA1Q15788 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
NCOA1Q15788 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC41.51■■■■■ 4.24
NCOA1Q15788 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
NCOA1Q15788 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC41.5■■■■■ 4.23
NCOA1Q15788 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
NCOA1Q15788 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.47■■■■■ 4.23
NCOA1Q15788 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC41.47■■■■■ 4.23
NCOA1Q15788 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
NCOA1Q15788 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC41.46■■■■■ 4.23
NCOA1Q15788 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
NCOA1Q15788 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
NCOA1Q15788 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC41.44■■■■■ 4.23
NCOA1Q15788 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC41.42■■■■■ 4.22
NCOA1Q15788 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC41.41■■■■■ 4.22
NCOA1Q15788 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.41■■■■■ 4.22
NCOA1Q15788 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
NCOA1Q15788 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
NCOA1Q15788 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
NCOA1Q15788 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC41.37■■■■■ 4.21
NCOA1Q15788 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
NCOA1Q15788 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
NCOA1Q15788 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
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