Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC44.19■■■■■ 4.66
NCOA1Q15788 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
NCOA1Q15788 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
NCOA1Q15788 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC44.1■■■■■ 4.65
NCOA1Q15788 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC44.1■■■■■ 4.65
NCOA1Q15788 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
NCOA1Q15788 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
NCOA1Q15788 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC44.06■■■■■ 4.64
NCOA1Q15788 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.05■■■■■ 4.64
NCOA1Q15788 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
NCOA1Q15788 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC44.02■■■■■ 4.64
NCOA1Q15788 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC44.02■■■■■ 4.64
NCOA1Q15788 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
NCOA1Q15788 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC44■■■■■ 4.63
NCOA1Q15788 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC44■■■■■ 4.63
NCOA1Q15788 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.94■■■■■ 4.62
NCOA1Q15788 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
NCOA1Q15788 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.91■■■■■ 4.62
NCOA1Q15788 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC43.9■■■■■ 4.62
NCOA1Q15788 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
NCOA1Q15788 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC43.85■■■■■ 4.61
NCOA1Q15788 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
NCOA1Q15788 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC43.82■■■■■ 4.6
NCOA1Q15788 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
NCOA1Q15788 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC43.77■■■■■ 4.6
NCOA1Q15788 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC43.77■■■■■ 4.6
NCOA1Q15788 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
NCOA1Q15788 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
NCOA1Q15788 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
NCOA1Q15788 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
NCOA1Q15788 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC43.66■■■■■ 4.58
NCOA1Q15788 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
NCOA1Q15788 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC43.62■■■■■ 4.57
NCOA1Q15788 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC43.59■■■■■ 4.57
NCOA1Q15788 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
NCOA1Q15788 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
NCOA1Q15788 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC43.49■■■■■ 4.55
NCOA1Q15788 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.48■■■■■ 4.55
NCOA1Q15788 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC43.45■■■■■ 4.55
NCOA1Q15788 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC43.43■■■■■ 4.54
NCOA1Q15788 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC43.36■■■■■ 4.53
NCOA1Q15788 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
NCOA1Q15788 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
NCOA1Q15788 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
NCOA1Q15788 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC43.3■■■■■ 4.52
NCOA1Q15788 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC43.3■■■■■ 4.52
NCOA1Q15788 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
NCOA1Q15788 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC43.25■■■■■ 4.51
NCOA1Q15788 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
NCOA1Q15788 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC43.18■■■■■ 4.5
NCOA1Q15788 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
NCOA1Q15788 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC43.13■■■■■ 4.49
NCOA1Q15788 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
NCOA1Q15788 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
NCOA1Q15788 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC43.09■■■■■ 4.49
NCOA1Q15788 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC43.02■■■■■ 4.48
NCOA1Q15788 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
NCOA1Q15788 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC42.97■■■■■ 4.47
NCOA1Q15788 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
NCOA1Q15788 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC42.96■■■■■ 4.47
NCOA1Q15788 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC42.95■■■■■ 4.47
NCOA1Q15788 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC42.94■■■■■ 4.46
NCOA1Q15788 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.92■■■■■ 4.46
NCOA1Q15788 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
NCOA1Q15788 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC42.89■■■■■ 4.46
NCOA1Q15788 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.46
NCOA1Q15788 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC42.88■■■■■ 4.45
NCOA1Q15788 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
NCOA1Q15788 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
NCOA1Q15788 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.84■■■■■ 4.45
NCOA1Q15788 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC42.84■■■■■ 4.45
NCOA1Q15788 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
NCOA1Q15788 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC42.83■■■■■ 4.45
NCOA1Q15788 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
NCOA1Q15788 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
NCOA1Q15788 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
NCOA1Q15788 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC42.77■■■■■ 4.44
NCOA1Q15788 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC42.76■■■■■ 4.44
NCOA1Q15788 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC42.75■■■■■ 4.43
NCOA1Q15788 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC42.71■■■■■ 4.43
NCOA1Q15788 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
NCOA1Q15788 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
NCOA1Q15788 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC42.66■■■■■ 4.42
NCOA1Q15788 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
NCOA1Q15788 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
NCOA1Q15788 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.62■■■■■ 4.41
NCOA1Q15788 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.62■■■■■ 4.41
NCOA1Q15788 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
NCOA1Q15788 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC42.57■■■■■ 4.41
NCOA1Q15788 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC42.57■■■■■ 4.41
NCOA1Q15788 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
NCOA1Q15788 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
NCOA1Q15788 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC42.52■■■■■ 4.4
NCOA1Q15788 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC42.47■■■■■ 4.39
NCOA1Q15788 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC42.47■■■■■ 4.39
NCOA1Q15788 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
NCOA1Q15788 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
NCOA1Q15788 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
NCOA1Q15788 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC42.44■■■■■ 4.38
NCOA1Q15788 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
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