Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC42.76■■■■■ 4.44
PTPRKQ15262 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
PTPRKQ15262 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
PTPRKQ15262 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
PTPRKQ15262 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
PTPRKQ15262 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
PTPRKQ15262 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC42.58■■■■■ 4.41
PTPRKQ15262 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC42.57■■■■■ 4.41
PTPRKQ15262 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC42.54■■■■■ 4.4
PTPRKQ15262 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
PTPRKQ15262 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
PTPRKQ15262 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC42.51■■■■■ 4.4
PTPRKQ15262 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC42.51■■■■■ 4.4
PTPRKQ15262 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
PTPRKQ15262 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.5■■■■■ 4.39
PTPRKQ15262 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC42.49■■■■■ 4.39
PTPRKQ15262 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC42.47■■■■■ 4.39
PTPRKQ15262 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC42.46■■■■■ 4.39
PTPRKQ15262 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
PTPRKQ15262 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC42.43■■■■■ 4.38
PTPRKQ15262 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
PTPRKQ15262 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
PTPRKQ15262 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.39■■■■■ 4.38
PTPRKQ15262 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
PTPRKQ15262 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
PTPRKQ15262 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC42.38■■■■■ 4.37
PTPRKQ15262 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
PTPRKQ15262 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC42.29■■■■■ 4.36
PTPRKQ15262 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.28■■■■■ 4.36
PTPRKQ15262 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
PTPRKQ15262 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
PTPRKQ15262 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.25■■■■■ 4.35
PTPRKQ15262 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
PTPRKQ15262 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.22■■■■■ 4.35
PTPRKQ15262 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC42.22■■■■■ 4.35
PTPRKQ15262 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
PTPRKQ15262 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC42.21■■■■■ 4.35
PTPRKQ15262 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
PTPRKQ15262 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
PTPRKQ15262 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC42.18■■■■■ 4.34
PTPRKQ15262 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC42.16■■■■■ 4.34
PTPRKQ15262 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
PTPRKQ15262 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
PTPRKQ15262 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
PTPRKQ15262 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
PTPRKQ15262 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
PTPRKQ15262 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC42.13■■■■■ 4.34
PTPRKQ15262 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC42.11■■■■■ 4.33
PTPRKQ15262 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
PTPRKQ15262 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC42.1■■■■■ 4.33
PTPRKQ15262 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.09■■■■■ 4.33
PTPRKQ15262 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
PTPRKQ15262 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
PTPRKQ15262 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
PTPRKQ15262 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
PTPRKQ15262 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC42.03■■■■■ 4.32
PTPRKQ15262 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC42.03■■■■■ 4.32
PTPRKQ15262 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
PTPRKQ15262 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
PTPRKQ15262 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
PTPRKQ15262 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.95■■■■■ 4.31
PTPRKQ15262 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC41.95■■■■■ 4.31
PTPRKQ15262 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
PTPRKQ15262 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
PTPRKQ15262 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
PTPRKQ15262 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC41.86■■■■■ 4.29
PTPRKQ15262 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
PTPRKQ15262 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC41.85■■■■■ 4.29
PTPRKQ15262 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
PTPRKQ15262 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
PTPRKQ15262 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
PTPRKQ15262 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC41.82■■■■■ 4.29
PTPRKQ15262 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.28
PTPRKQ15262 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.8■■■■■ 4.28
PTPRKQ15262 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
PTPRKQ15262 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC41.78■■■■■ 4.28
PTPRKQ15262 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
PTPRKQ15262 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
PTPRKQ15262 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
PTPRKQ15262 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC41.72■■■■■ 4.27
PTPRKQ15262 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC41.72■■■■■ 4.27
PTPRKQ15262 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
PTPRKQ15262 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
PTPRKQ15262 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC41.7■■■■■ 4.27
PTPRKQ15262 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC41.69■■■■■ 4.27
PTPRKQ15262 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC41.69■■■■■ 4.26
PTPRKQ15262 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC41.69■■■■■ 4.26
PTPRKQ15262 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.26
PTPRKQ15262 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC41.69■■■■■ 4.26
PTPRKQ15262 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.68■■■■■ 4.26
PTPRKQ15262 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC41.67■■■■■ 4.26
PTPRKQ15262 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
PTPRKQ15262 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC41.65■■■■■ 4.26
PTPRKQ15262 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
PTPRKQ15262 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
PTPRKQ15262 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.61■■■■■ 4.25
PTPRKQ15262 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.6■■■■■ 4.25
PTPRKQ15262 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
PTPRKQ15262 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
PTPRKQ15262 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC41.57■■■■■ 4.25
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