Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LAPTM4AQ15012 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LAPTM4AQ15012 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LAPTM4AQ15012 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAPTM4AQ15012 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAPTM4AQ15012 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LAPTM4AQ15012 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LAPTM4AQ15012 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAPTM4AQ15012 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAPTM4AQ15012 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAPTM4AQ15012 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAPTM4AQ15012 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAPTM4AQ15012 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAPTM4AQ15012 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAPTM4AQ15012 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAPTM4AQ15012 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAPTM4AQ15012 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAPTM4AQ15012 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAPTM4AQ15012 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAPTM4AQ15012 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LAPTM4AQ15012 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAPTM4AQ15012 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LAPTM4AQ15012 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LAPTM4AQ15012 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LAPTM4AQ15012 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAPTM4AQ15012 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAPTM4AQ15012 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAPTM4AQ15012 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAPTM4AQ15012 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAPTM4AQ15012 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LAPTM4AQ15012 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LAPTM4AQ15012 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAPTM4AQ15012 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAPTM4AQ15012 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAPTM4AQ15012 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LAPTM4AQ15012 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAPTM4AQ15012 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAPTM4AQ15012 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAPTM4AQ15012 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAPTM4AQ15012 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAPTM4AQ15012 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAPTM4AQ15012 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAPTM4AQ15012 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAPTM4AQ15012 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAPTM4AQ15012 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAPTM4AQ15012 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LAPTM4AQ15012 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAPTM4AQ15012 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAPTM4AQ15012 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAPTM4AQ15012 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAPTM4AQ15012 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAPTM4AQ15012 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAPTM4AQ15012 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAPTM4AQ15012 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LAPTM4AQ15012 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LAPTM4AQ15012 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAPTM4AQ15012 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAPTM4AQ15012 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAPTM4AQ15012 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAPTM4AQ15012 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAPTM4AQ15012 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAPTM4AQ15012 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAPTM4AQ15012 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAPTM4AQ15012 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAPTM4AQ15012 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LAPTM4AQ15012 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAPTM4AQ15012 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LAPTM4AQ15012 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LAPTM4AQ15012 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAPTM4AQ15012 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LAPTM4AQ15012 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAPTM4AQ15012 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAPTM4AQ15012 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAPTM4AQ15012 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAPTM4AQ15012 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAPTM4AQ15012 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAPTM4AQ15012 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAPTM4AQ15012 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAPTM4AQ15012 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LAPTM4AQ15012 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LAPTM4AQ15012 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LAPTM4AQ15012 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LAPTM4AQ15012 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LAPTM4AQ15012 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAPTM4AQ15012 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAPTM4AQ15012 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAPTM4AQ15012 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAPTM4AQ15012 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAPTM4AQ15012 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAPTM4AQ15012 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAPTM4AQ15012 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAPTM4AQ15012 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAPTM4AQ15012 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAPTM4AQ15012 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAPTM4AQ15012 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAPTM4AQ15012 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAPTM4AQ15012 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAPTM4AQ15012 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAPTM4AQ15012 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAPTM4AQ15012 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
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