Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LAPTM4AQ15012 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LAPTM4AQ15012 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LAPTM4AQ15012 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAPTM4AQ15012 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAPTM4AQ15012 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LAPTM4AQ15012 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LAPTM4AQ15012 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAPTM4AQ15012 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAPTM4AQ15012 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAPTM4AQ15012 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAPTM4AQ15012 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAPTM4AQ15012 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAPTM4AQ15012 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAPTM4AQ15012 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAPTM4AQ15012 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAPTM4AQ15012 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAPTM4AQ15012 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAPTM4AQ15012 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAPTM4AQ15012 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LAPTM4AQ15012 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAPTM4AQ15012 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LAPTM4AQ15012 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LAPTM4AQ15012 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LAPTM4AQ15012 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAPTM4AQ15012 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAPTM4AQ15012 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAPTM4AQ15012 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAPTM4AQ15012 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAPTM4AQ15012 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LAPTM4AQ15012 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LAPTM4AQ15012 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAPTM4AQ15012 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAPTM4AQ15012 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAPTM4AQ15012 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LAPTM4AQ15012 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAPTM4AQ15012 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAPTM4AQ15012 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAPTM4AQ15012 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAPTM4AQ15012 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAPTM4AQ15012 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAPTM4AQ15012 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAPTM4AQ15012 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAPTM4AQ15012 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAPTM4AQ15012 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAPTM4AQ15012 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LAPTM4AQ15012 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAPTM4AQ15012 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAPTM4AQ15012 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAPTM4AQ15012 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAPTM4AQ15012 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAPTM4AQ15012 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAPTM4AQ15012 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAPTM4AQ15012 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LAPTM4AQ15012 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LAPTM4AQ15012 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAPTM4AQ15012 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAPTM4AQ15012 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAPTM4AQ15012 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAPTM4AQ15012 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAPTM4AQ15012 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAPTM4AQ15012 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAPTM4AQ15012 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAPTM4AQ15012 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAPTM4AQ15012 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LAPTM4AQ15012 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAPTM4AQ15012 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LAPTM4AQ15012 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LAPTM4AQ15012 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAPTM4AQ15012 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LAPTM4AQ15012 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAPTM4AQ15012 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAPTM4AQ15012 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAPTM4AQ15012 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAPTM4AQ15012 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAPTM4AQ15012 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAPTM4AQ15012 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAPTM4AQ15012 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAPTM4AQ15012 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LAPTM4AQ15012 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LAPTM4AQ15012 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LAPTM4AQ15012 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LAPTM4AQ15012 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LAPTM4AQ15012 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAPTM4AQ15012 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAPTM4AQ15012 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAPTM4AQ15012 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAPTM4AQ15012 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAPTM4AQ15012 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAPTM4AQ15012 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAPTM4AQ15012 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAPTM4AQ15012 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAPTM4AQ15012 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAPTM4AQ15012 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAPTM4AQ15012 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAPTM4AQ15012 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAPTM4AQ15012 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAPTM4AQ15012 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAPTM4AQ15012 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAPTM4AQ15012 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
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