Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CAPSQ13938 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CAPSQ13938 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CAPSQ13938 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CAPSQ13938 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CAPSQ13938 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CAPSQ13938 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CAPSQ13938 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
CAPSQ13938 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
CAPSQ13938 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CAPSQ13938 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CAPSQ13938 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CAPSQ13938 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CAPSQ13938 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CAPSQ13938 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CAPSQ13938 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CAPSQ13938 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CAPSQ13938 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CAPSQ13938 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CAPSQ13938 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CAPSQ13938 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CAPSQ13938 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CAPSQ13938 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CAPSQ13938 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
CAPSQ13938 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CAPSQ13938 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CAPSQ13938 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CAPSQ13938 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CAPSQ13938 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CAPSQ13938 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CAPSQ13938 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CAPSQ13938 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CAPSQ13938 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CAPSQ13938 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CAPSQ13938 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CAPSQ13938 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CAPSQ13938 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CAPSQ13938 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CAPSQ13938 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CAPSQ13938 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CAPSQ13938 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CAPSQ13938 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
CAPSQ13938 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
CAPSQ13938 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CAPSQ13938 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CAPSQ13938 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CAPSQ13938 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CAPSQ13938 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
CAPSQ13938 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CAPSQ13938 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CAPSQ13938 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CAPSQ13938 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CAPSQ13938 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CAPSQ13938 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CAPSQ13938 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CAPSQ13938 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CAPSQ13938 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CAPSQ13938 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CAPSQ13938 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
CAPSQ13938 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CAPSQ13938 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CAPSQ13938 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CAPSQ13938 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CAPSQ13938 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CAPSQ13938 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CAPSQ13938 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CAPSQ13938 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CAPSQ13938 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CAPSQ13938 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CAPSQ13938 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CAPSQ13938 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CAPSQ13938 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CAPSQ13938 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CAPSQ13938 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CAPSQ13938 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CAPSQ13938 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CAPSQ13938 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CAPSQ13938 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CAPSQ13938 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CAPSQ13938 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CAPSQ13938 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CAPSQ13938 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CAPSQ13938 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CAPSQ13938 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CAPSQ13938 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CAPSQ13938 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CAPSQ13938 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CAPSQ13938 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CAPSQ13938 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CAPSQ13938 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CAPSQ13938 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CAPSQ13938 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CAPSQ13938 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
CAPSQ13938 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CAPSQ13938 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CAPSQ13938 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CAPSQ13938 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CAPSQ13938 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CAPSQ13938 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CAPSQ13938 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
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