Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATRQ13535 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATRQ13535 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATRQ13535 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATRQ13535 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATRQ13535 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATRQ13535 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATRQ13535 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATRQ13535 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATRQ13535 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATRQ13535 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATRQ13535 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATRQ13535 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATRQ13535 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATRQ13535 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATRQ13535 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATRQ13535 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATRQ13535 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATRQ13535 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATRQ13535 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATRQ13535 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATRQ13535 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATRQ13535 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATRQ13535 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATRQ13535 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATRQ13535 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATRQ13535 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATRQ13535 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATRQ13535 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATRQ13535 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATRQ13535 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATRQ13535 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATRQ13535 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATRQ13535 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATRQ13535 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATRQ13535 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATRQ13535 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATRQ13535 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATRQ13535 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATRQ13535 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATRQ13535 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATRQ13535 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATRQ13535 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATRQ13535 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATRQ13535 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATRQ13535 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATRQ13535 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATRQ13535 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATRQ13535 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATRQ13535 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATRQ13535 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATRQ13535 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATRQ13535 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATRQ13535 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATRQ13535 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATRQ13535 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATRQ13535 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATRQ13535 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATRQ13535 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATRQ13535 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATRQ13535 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATRQ13535 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRQ13535 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRQ13535 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATRQ13535 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATRQ13535 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATRQ13535 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATRQ13535 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATRQ13535 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATRQ13535 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATRQ13535 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATRQ13535 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATRQ13535 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATRQ13535 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATRQ13535 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATRQ13535 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATRQ13535 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATRQ13535 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATRQ13535 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATRQ13535 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATRQ13535 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATRQ13535 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATRQ13535 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATRQ13535 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATRQ13535 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATRQ13535 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATRQ13535 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATRQ13535 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATRQ13535 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRQ13535 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATRQ13535 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATRQ13535 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATRQ13535 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATRQ13535 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATRQ13535 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATRQ13535 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATRQ13535 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATRQ13535 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATRQ13535 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATRQ13535 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
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