Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP3AQ13472 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOP3AQ13472 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOP3AQ13472 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOP3AQ13472 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOP3AQ13472 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOP3AQ13472 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOP3AQ13472 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOP3AQ13472 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOP3AQ13472 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOP3AQ13472 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TOP3AQ13472 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TOP3AQ13472 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TOP3AQ13472 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TOP3AQ13472 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TOP3AQ13472 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOP3AQ13472 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOP3AQ13472 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOP3AQ13472 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOP3AQ13472 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOP3AQ13472 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOP3AQ13472 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOP3AQ13472 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOP3AQ13472 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOP3AQ13472 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TOP3AQ13472 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOP3AQ13472 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOP3AQ13472 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TOP3AQ13472 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOP3AQ13472 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TOP3AQ13472 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TOP3AQ13472 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TOP3AQ13472 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TOP3AQ13472 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TOP3AQ13472 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TOP3AQ13472 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TOP3AQ13472 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TOP3AQ13472 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TOP3AQ13472 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TOP3AQ13472 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TOP3AQ13472 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TOP3AQ13472 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TOP3AQ13472 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP3AQ13472 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP3AQ13472 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOP3AQ13472 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOP3AQ13472 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TOP3AQ13472 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOP3AQ13472 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOP3AQ13472 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOP3AQ13472 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOP3AQ13472 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOP3AQ13472 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOP3AQ13472 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOP3AQ13472 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP3AQ13472 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP3AQ13472 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP3AQ13472 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP3AQ13472 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP3AQ13472 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TOP3AQ13472 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOP3AQ13472 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOP3AQ13472 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOP3AQ13472 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOP3AQ13472 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOP3AQ13472 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOP3AQ13472 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOP3AQ13472 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TOP3AQ13472 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOP3AQ13472 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOP3AQ13472 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOP3AQ13472 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOP3AQ13472 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOP3AQ13472 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TOP3AQ13472 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOP3AQ13472 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOP3AQ13472 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOP3AQ13472 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOP3AQ13472 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOP3AQ13472 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOP3AQ13472 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP3AQ13472 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP3AQ13472 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP3AQ13472 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP3AQ13472 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOP3AQ13472 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOP3AQ13472 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOP3AQ13472 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOP3AQ13472 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOP3AQ13472 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOP3AQ13472 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TOP3AQ13472 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TOP3AQ13472 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOP3AQ13472 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOP3AQ13472 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP3AQ13472 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP3AQ13472 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP3AQ13472 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TOP3AQ13472 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TOP3AQ13472 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
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