Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
SF3B2Q13435 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
SF3B2Q13435 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
SF3B2Q13435 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
SF3B2Q13435 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
SF3B2Q13435 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
SF3B2Q13435 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
SF3B2Q13435 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
SF3B2Q13435 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
SF3B2Q13435 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
SF3B2Q13435 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC37.54■■■■□ 3.6
SF3B2Q13435 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
SF3B2Q13435 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.52■■■■□ 3.6
SF3B2Q13435 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
SF3B2Q13435 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
SF3B2Q13435 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
SF3B2Q13435 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
SF3B2Q13435 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
SF3B2Q13435 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
SF3B2Q13435 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
SF3B2Q13435 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
SF3B2Q13435 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
SF3B2Q13435 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
SF3B2Q13435 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
SF3B2Q13435 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
SF3B2Q13435 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
SF3B2Q13435 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
SF3B2Q13435 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
SF3B2Q13435 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
SF3B2Q13435 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
SF3B2Q13435 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
SF3B2Q13435 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
SF3B2Q13435 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
SF3B2Q13435 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
SF3B2Q13435 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
SF3B2Q13435 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
SF3B2Q13435 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
SF3B2Q13435 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
SF3B2Q13435 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
SF3B2Q13435 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
SF3B2Q13435 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
SF3B2Q13435 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
SF3B2Q13435 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
SF3B2Q13435 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
SF3B2Q13435 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
SF3B2Q13435 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
SF3B2Q13435 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
SF3B2Q13435 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
SF3B2Q13435 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
SF3B2Q13435 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
SF3B2Q13435 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SF3B2Q13435 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
SF3B2Q13435 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
SF3B2Q13435 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
SF3B2Q13435 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
SF3B2Q13435 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC36.97■■■■□ 3.51
SF3B2Q13435 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
SF3B2Q13435 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
SF3B2Q13435 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
SF3B2Q13435 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
SF3B2Q13435 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
SF3B2Q13435 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
SF3B2Q13435 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
SF3B2Q13435 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
SF3B2Q13435 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
SF3B2Q13435 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
SF3B2Q13435 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC36.9■■■■□ 3.5
SF3B2Q13435 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
SF3B2Q13435 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
SF3B2Q13435 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SF3B2Q13435 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SF3B2Q13435 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
SF3B2Q13435 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC36.85■■■■□ 3.49
SF3B2Q13435 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
SF3B2Q13435 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.49
SF3B2Q13435 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
SF3B2Q13435 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SF3B2Q13435 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SF3B2Q13435 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
SF3B2Q13435 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
SF3B2Q13435 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
SF3B2Q13435 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SF3B2Q13435 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SF3B2Q13435 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SF3B2Q13435 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SF3B2Q13435 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
SF3B2Q13435 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SF3B2Q13435 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
SF3B2Q13435 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
SF3B2Q13435 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
SF3B2Q13435 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
SF3B2Q13435 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
SF3B2Q13435 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SF3B2Q13435 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SF3B2Q13435 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
SF3B2Q13435 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
SF3B2Q13435 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
SF3B2Q13435 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
SF3B2Q13435 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
SF3B2Q13435 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
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