Protein–RNA interactions for Protein: Q13405

MRPL49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL49Q13405 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPL49Q13405 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPL49Q13405 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPL49Q13405 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPL49Q13405 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPL49Q13405 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPL49Q13405 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPL49Q13405 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPL49Q13405 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MRPL49Q13405 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRPL49Q13405 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRPL49Q13405 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPL49Q13405 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPL49Q13405 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPL49Q13405 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPL49Q13405 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPL49Q13405 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPL49Q13405 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPL49Q13405 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRPL49Q13405 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRPL49Q13405 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRPL49Q13405 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MRPL49Q13405 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MRPL49Q13405 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPL49Q13405 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPL49Q13405 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPL49Q13405 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL49Q13405 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL49Q13405 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPL49Q13405 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL49Q13405 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL49Q13405 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL49Q13405 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL49Q13405 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL49Q13405 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL49Q13405 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL49Q13405 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL49Q13405 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL49Q13405 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL49Q13405 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL49Q13405 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL49Q13405 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL49Q13405 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL49Q13405 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL49Q13405 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL49Q13405 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL49Q13405 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL49Q13405 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL49Q13405 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL49Q13405 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRPL49Q13405 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRPL49Q13405 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRPL49Q13405 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MRPL49Q13405 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRPL49Q13405 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPL49Q13405 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPL49Q13405 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MRPL49Q13405 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPL49Q13405 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPL49Q13405 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRPL49Q13405 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRPL49Q13405 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRPL49Q13405 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRPL49Q13405 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRPL49Q13405 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MRPL49Q13405 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MRPL49Q13405 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MRPL49Q13405 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MRPL49Q13405 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRPL49Q13405 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRPL49Q13405 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRPL49Q13405 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRPL49Q13405 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MRPL49Q13405 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRPL49Q13405 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MRPL49Q13405 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRPL49Q13405 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRPL49Q13405 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPL49Q13405 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPL49Q13405 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPL49Q13405 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL49Q13405 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL49Q13405 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPL49Q13405 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL49Q13405 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPL49Q13405 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPL49Q13405 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MRPL49Q13405 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MRPL49Q13405 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPL49Q13405 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPL49Q13405 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPL49Q13405 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPL49Q13405 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRPL49Q13405 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPL49Q13405 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPL49Q13405 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MRPL49Q13405 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MRPL49Q13405 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MRPL49Q13405 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MRPL49Q13405 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms