Protein–RNA interactions for Protein: Q13405

MRPL49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL49Q13405 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
MRPL49Q13405 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
MRPL49Q13405 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
MRPL49Q13405 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
MRPL49Q13405 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MRPL49Q13405 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MRPL49Q13405 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
MRPL49Q13405 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MRPL49Q13405 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
MRPL49Q13405 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MRPL49Q13405 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MRPL49Q13405 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
MRPL49Q13405 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MRPL49Q13405 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MRPL49Q13405 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MRPL49Q13405 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MRPL49Q13405 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MRPL49Q13405 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MRPL49Q13405 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MRPL49Q13405 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MRPL49Q13405 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MRPL49Q13405 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MRPL49Q13405 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MRPL49Q13405 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MRPL49Q13405 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
MRPL49Q13405 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MRPL49Q13405 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MRPL49Q13405 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MRPL49Q13405 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MRPL49Q13405 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MRPL49Q13405 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
MRPL49Q13405 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
MRPL49Q13405 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MRPL49Q13405 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MRPL49Q13405 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MRPL49Q13405 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MRPL49Q13405 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MRPL49Q13405 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
MRPL49Q13405 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MRPL49Q13405 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MRPL49Q13405 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MRPL49Q13405 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MRPL49Q13405 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MRPL49Q13405 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MRPL49Q13405 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MRPL49Q13405 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MRPL49Q13405 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MRPL49Q13405 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MRPL49Q13405 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MRPL49Q13405 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MRPL49Q13405 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MRPL49Q13405 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MRPL49Q13405 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MRPL49Q13405 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MRPL49Q13405 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MRPL49Q13405 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MRPL49Q13405 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MRPL49Q13405 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MRPL49Q13405 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MRPL49Q13405 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MRPL49Q13405 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MRPL49Q13405 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MRPL49Q13405 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MRPL49Q13405 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MRPL49Q13405 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MRPL49Q13405 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MRPL49Q13405 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MRPL49Q13405 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MRPL49Q13405 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MRPL49Q13405 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MRPL49Q13405 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MRPL49Q13405 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MRPL49Q13405 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MRPL49Q13405 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MRPL49Q13405 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MRPL49Q13405 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
MRPL49Q13405 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MRPL49Q13405 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MRPL49Q13405 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MRPL49Q13405 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MRPL49Q13405 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MRPL49Q13405 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MRPL49Q13405 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MRPL49Q13405 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MRPL49Q13405 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MRPL49Q13405 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MRPL49Q13405 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MRPL49Q13405 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MRPL49Q13405 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MRPL49Q13405 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MRPL49Q13405 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MRPL49Q13405 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MRPL49Q13405 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MRPL49Q13405 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MRPL49Q13405 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
MRPL49Q13405 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MRPL49Q13405 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MRPL49Q13405 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MRPL49Q13405 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MRPL49Q13405 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
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