Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TRAF1Q13077 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TRAF1Q13077 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TRAF1Q13077 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TRAF1Q13077 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TRAF1Q13077 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TRAF1Q13077 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TRAF1Q13077 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TRAF1Q13077 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TRAF1Q13077 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TRAF1Q13077 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
TRAF1Q13077 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
TRAF1Q13077 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TRAF1Q13077 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TRAF1Q13077 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
TRAF1Q13077 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TRAF1Q13077 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
TRAF1Q13077 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
TRAF1Q13077 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
TRAF1Q13077 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TRAF1Q13077 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
TRAF1Q13077 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TRAF1Q13077 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TRAF1Q13077 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TRAF1Q13077 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
TRAF1Q13077 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TRAF1Q13077 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
TRAF1Q13077 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
TRAF1Q13077 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
TRAF1Q13077 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TRAF1Q13077 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TRAF1Q13077 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TRAF1Q13077 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TRAF1Q13077 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TRAF1Q13077 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TRAF1Q13077 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TRAF1Q13077 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
TRAF1Q13077 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TRAF1Q13077 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TRAF1Q13077 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TRAF1Q13077 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TRAF1Q13077 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TRAF1Q13077 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TRAF1Q13077 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
TRAF1Q13077 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
TRAF1Q13077 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TRAF1Q13077 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TRAF1Q13077 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TRAF1Q13077 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TRAF1Q13077 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TRAF1Q13077 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TRAF1Q13077 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TRAF1Q13077 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
TRAF1Q13077 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
TRAF1Q13077 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
TRAF1Q13077 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TRAF1Q13077 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TRAF1Q13077 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TRAF1Q13077 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TRAF1Q13077 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TRAF1Q13077 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TRAF1Q13077 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TRAF1Q13077 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TRAF1Q13077 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TRAF1Q13077 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TRAF1Q13077 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TRAF1Q13077 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TRAF1Q13077 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TRAF1Q13077 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TRAF1Q13077 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TRAF1Q13077 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TRAF1Q13077 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TRAF1Q13077 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TRAF1Q13077 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TRAF1Q13077 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TRAF1Q13077 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TRAF1Q13077 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
TRAF1Q13077 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TRAF1Q13077 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
TRAF1Q13077 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
TRAF1Q13077 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TRAF1Q13077 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TRAF1Q13077 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TRAF1Q13077 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
TRAF1Q13077 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TRAF1Q13077 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TRAF1Q13077 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TRAF1Q13077 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TRAF1Q13077 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TRAF1Q13077 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TRAF1Q13077 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
TRAF1Q13077 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TRAF1Q13077 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TRAF1Q13077 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TRAF1Q13077 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TRAF1Q13077 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
TRAF1Q13077 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TRAF1Q13077 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TRAF1Q13077 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TRAF1Q13077 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
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