Protein–RNA interactions for Protein: Q12979

ABR, Active breakpoint cluster region-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRQ12979 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ABRQ12979 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ABRQ12979 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ABRQ12979 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ABRQ12979 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ABRQ12979 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ABRQ12979 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ABRQ12979 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABRQ12979 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABRQ12979 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ABRQ12979 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABRQ12979 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABRQ12979 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABRQ12979 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABRQ12979 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABRQ12979 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABRQ12979 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABRQ12979 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABRQ12979 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABRQ12979 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABRQ12979 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABRQ12979 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABRQ12979 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABRQ12979 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ABRQ12979 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ABRQ12979 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABRQ12979 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABRQ12979 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABRQ12979 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABRQ12979 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABRQ12979 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABRQ12979 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABRQ12979 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABRQ12979 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABRQ12979 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABRQ12979 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABRQ12979 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABRQ12979 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABRQ12979 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABRQ12979 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABRQ12979 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
ABRQ12979 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ABRQ12979 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ABRQ12979 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABRQ12979 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABRQ12979 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABRQ12979 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ABRQ12979 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABRQ12979 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABRQ12979 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABRQ12979 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABRQ12979 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABRQ12979 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABRQ12979 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABRQ12979 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABRQ12979 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABRQ12979 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABRQ12979 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ABRQ12979 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABRQ12979 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABRQ12979 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABRQ12979 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABRQ12979 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABRQ12979 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABRQ12979 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABRQ12979 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABRQ12979 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABRQ12979 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABRQ12979 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABRQ12979 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABRQ12979 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABRQ12979 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ABRQ12979 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ABRQ12979 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABRQ12979 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABRQ12979 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABRQ12979 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABRQ12979 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABRQ12979 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABRQ12979 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABRQ12979 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABRQ12979 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABRQ12979 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABRQ12979 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABRQ12979 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABRQ12979 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABRQ12979 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABRQ12979 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABRQ12979 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABRQ12979 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABRQ12979 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ABRQ12979 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ABRQ12979 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABRQ12979 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ABRQ12979 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABRQ12979 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABRQ12979 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABRQ12979 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABRQ12979 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABRQ12979 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms