Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
LMOD3Q0VAK6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
LMOD3Q0VAK6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
LMOD3Q0VAK6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
LMOD3Q0VAK6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
LMOD3Q0VAK6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.42
LMOD3Q0VAK6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
LMOD3Q0VAK6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
LMOD3Q0VAK6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
LMOD3Q0VAK6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
LMOD3Q0VAK6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
LMOD3Q0VAK6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
LMOD3Q0VAK6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
LMOD3Q0VAK6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
LMOD3Q0VAK6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
LMOD3Q0VAK6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC36.35■■■■□ 3.41
LMOD3Q0VAK6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
LMOD3Q0VAK6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
LMOD3Q0VAK6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
LMOD3Q0VAK6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
LMOD3Q0VAK6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
LMOD3Q0VAK6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
LMOD3Q0VAK6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
LMOD3Q0VAK6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
LMOD3Q0VAK6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
LMOD3Q0VAK6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
LMOD3Q0VAK6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
LMOD3Q0VAK6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
LMOD3Q0VAK6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
LMOD3Q0VAK6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
LMOD3Q0VAK6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
LMOD3Q0VAK6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
LMOD3Q0VAK6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
LMOD3Q0VAK6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
LMOD3Q0VAK6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
LMOD3Q0VAK6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
LMOD3Q0VAK6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
LMOD3Q0VAK6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
LMOD3Q0VAK6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
LMOD3Q0VAK6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
LMOD3Q0VAK6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
LMOD3Q0VAK6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
LMOD3Q0VAK6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
LMOD3Q0VAK6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
LMOD3Q0VAK6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
LMOD3Q0VAK6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
LMOD3Q0VAK6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
LMOD3Q0VAK6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
LMOD3Q0VAK6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
LMOD3Q0VAK6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
LMOD3Q0VAK6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
LMOD3Q0VAK6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
LMOD3Q0VAK6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
LMOD3Q0VAK6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
LMOD3Q0VAK6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
LMOD3Q0VAK6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
LMOD3Q0VAK6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
LMOD3Q0VAK6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
LMOD3Q0VAK6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
LMOD3Q0VAK6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
LMOD3Q0VAK6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
LMOD3Q0VAK6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
LMOD3Q0VAK6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
LMOD3Q0VAK6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
LMOD3Q0VAK6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
LMOD3Q0VAK6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
LMOD3Q0VAK6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
LMOD3Q0VAK6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
LMOD3Q0VAK6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
LMOD3Q0VAK6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
LMOD3Q0VAK6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
LMOD3Q0VAK6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
LMOD3Q0VAK6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
LMOD3Q0VAK6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
LMOD3Q0VAK6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
LMOD3Q0VAK6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
LMOD3Q0VAK6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
LMOD3Q0VAK6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
LMOD3Q0VAK6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
LMOD3Q0VAK6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
LMOD3Q0VAK6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
LMOD3Q0VAK6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
LMOD3Q0VAK6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
LMOD3Q0VAK6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
LMOD3Q0VAK6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
LMOD3Q0VAK6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
LMOD3Q0VAK6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
LMOD3Q0VAK6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
LMOD3Q0VAK6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
LMOD3Q0VAK6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
LMOD3Q0VAK6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
LMOD3Q0VAK6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
LMOD3Q0VAK6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
LMOD3Q0VAK6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
LMOD3Q0VAK6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
LMOD3Q0VAK6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
LMOD3Q0VAK6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
LMOD3Q0VAK6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
LMOD3Q0VAK6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
LMOD3Q0VAK6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms