Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ACVR1Q04771 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ACVR1Q04771 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ACVR1Q04771 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ACVR1Q04771 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ACVR1Q04771 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ACVR1Q04771 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ACVR1Q04771 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ACVR1Q04771 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ACVR1Q04771 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ACVR1Q04771 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ACVR1Q04771 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ACVR1Q04771 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ACVR1Q04771 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ACVR1Q04771 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ACVR1Q04771 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ACVR1Q04771 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ACVR1Q04771 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ACVR1Q04771 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ACVR1Q04771 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ACVR1Q04771 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ACVR1Q04771 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ACVR1Q04771 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ACVR1Q04771 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ACVR1Q04771 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ACVR1Q04771 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ACVR1Q04771 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ACVR1Q04771 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ACVR1Q04771 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ACVR1Q04771 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ACVR1Q04771 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ACVR1Q04771 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ACVR1Q04771 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ACVR1Q04771 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ACVR1Q04771 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ACVR1Q04771 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ACVR1Q04771 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ACVR1Q04771 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ACVR1Q04771 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ACVR1Q04771 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ACVR1Q04771 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ACVR1Q04771 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ACVR1Q04771 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ACVR1Q04771 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ACVR1Q04771 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ACVR1Q04771 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ACVR1Q04771 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ACVR1Q04771 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ACVR1Q04771 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ACVR1Q04771 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ACVR1Q04771 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ACVR1Q04771 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ACVR1Q04771 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ACVR1Q04771 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ACVR1Q04771 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ACVR1Q04771 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ACVR1Q04771 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ACVR1Q04771 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ACVR1Q04771 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ACVR1Q04771 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ACVR1Q04771 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ACVR1Q04771 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ACVR1Q04771 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ACVR1Q04771 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ACVR1Q04771 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ACVR1Q04771 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ACVR1Q04771 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ACVR1Q04771 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ACVR1Q04771 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ACVR1Q04771 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ACVR1Q04771 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ACVR1Q04771 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ACVR1Q04771 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ACVR1Q04771 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ACVR1Q04771 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ACVR1Q04771 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ACVR1Q04771 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ACVR1Q04771 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ACVR1Q04771 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ACVR1Q04771 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ACVR1Q04771 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ACVR1Q04771 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ACVR1Q04771 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ACVR1Q04771 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ACVR1Q04771 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ACVR1Q04771 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ACVR1Q04771 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ACVR1Q04771 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ACVR1Q04771 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ACVR1Q04771 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ACVR1Q04771 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ACVR1Q04771 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ACVR1Q04771 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ACVR1Q04771 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ACVR1Q04771 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ACVR1Q04771 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ACVR1Q04771 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ACVR1Q04771 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ACVR1Q04771 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ACVR1Q04771 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms