Protein–RNA interactions for Protein: Q03252

LMNB2, Lamin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB2Q03252 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LMNB2Q03252 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LMNB2Q03252 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
LMNB2Q03252 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LMNB2Q03252 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LMNB2Q03252 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LMNB2Q03252 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LMNB2Q03252 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LMNB2Q03252 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LMNB2Q03252 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LMNB2Q03252 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LMNB2Q03252 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LMNB2Q03252 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LMNB2Q03252 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LMNB2Q03252 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LMNB2Q03252 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LMNB2Q03252 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LMNB2Q03252 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LMNB2Q03252 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LMNB2Q03252 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LMNB2Q03252 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LMNB2Q03252 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LMNB2Q03252 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LMNB2Q03252 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LMNB2Q03252 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LMNB2Q03252 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LMNB2Q03252 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMNB2Q03252 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LMNB2Q03252 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LMNB2Q03252 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LMNB2Q03252 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LMNB2Q03252 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LMNB2Q03252 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
LMNB2Q03252 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
LMNB2Q03252 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LMNB2Q03252 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMNB2Q03252 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMNB2Q03252 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMNB2Q03252 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMNB2Q03252 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMNB2Q03252 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMNB2Q03252 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
LMNB2Q03252 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LMNB2Q03252 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LMNB2Q03252 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
LMNB2Q03252 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
LMNB2Q03252 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LMNB2Q03252 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LMNB2Q03252 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LMNB2Q03252 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LMNB2Q03252 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LMNB2Q03252 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LMNB2Q03252 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LMNB2Q03252 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LMNB2Q03252 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LMNB2Q03252 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LMNB2Q03252 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LMNB2Q03252 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMNB2Q03252 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMNB2Q03252 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LMNB2Q03252 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LMNB2Q03252 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LMNB2Q03252 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LMNB2Q03252 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LMNB2Q03252 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMNB2Q03252 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMNB2Q03252 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMNB2Q03252 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMNB2Q03252 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMNB2Q03252 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMNB2Q03252 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMNB2Q03252 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMNB2Q03252 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMNB2Q03252 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMNB2Q03252 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMNB2Q03252 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LMNB2Q03252 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMNB2Q03252 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMNB2Q03252 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMNB2Q03252 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMNB2Q03252 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMNB2Q03252 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMNB2Q03252 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMNB2Q03252 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMNB2Q03252 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMNB2Q03252 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMNB2Q03252 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMNB2Q03252 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMNB2Q03252 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LMNB2Q03252 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LMNB2Q03252 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LMNB2Q03252 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LMNB2Q03252 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LMNB2Q03252 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMNB2Q03252 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMNB2Q03252 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMNB2Q03252 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMNB2Q03252 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMNB2Q03252 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMNB2Q03252 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms