Protein–RNA interactions for Protein: Q02548

PAX5, Paired box protein Pax-5, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX5Q02548 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAX5Q02548 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAX5Q02548 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAX5Q02548 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PAX5Q02548 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAX5Q02548 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAX5Q02548 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAX5Q02548 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAX5Q02548 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAX5Q02548 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAX5Q02548 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAX5Q02548 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAX5Q02548 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAX5Q02548 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PAX5Q02548 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAX5Q02548 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAX5Q02548 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAX5Q02548 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAX5Q02548 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAX5Q02548 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAX5Q02548 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAX5Q02548 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAX5Q02548 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAX5Q02548 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAX5Q02548 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAX5Q02548 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAX5Q02548 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAX5Q02548 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAX5Q02548 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAX5Q02548 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAX5Q02548 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PAX5Q02548 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAX5Q02548 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAX5Q02548 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAX5Q02548 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAX5Q02548 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAX5Q02548 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAX5Q02548 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAX5Q02548 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAX5Q02548 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAX5Q02548 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PAX5Q02548 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAX5Q02548 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAX5Q02548 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAX5Q02548 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAX5Q02548 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAX5Q02548 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAX5Q02548 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAX5Q02548 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAX5Q02548 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAX5Q02548 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAX5Q02548 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAX5Q02548 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAX5Q02548 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAX5Q02548 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAX5Q02548 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAX5Q02548 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAX5Q02548 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAX5Q02548 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAX5Q02548 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAX5Q02548 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAX5Q02548 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAX5Q02548 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAX5Q02548 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAX5Q02548 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAX5Q02548 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAX5Q02548 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAX5Q02548 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAX5Q02548 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAX5Q02548 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAX5Q02548 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAX5Q02548 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAX5Q02548 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAX5Q02548 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAX5Q02548 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAX5Q02548 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAX5Q02548 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAX5Q02548 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAX5Q02548 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAX5Q02548 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAX5Q02548 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAX5Q02548 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAX5Q02548 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAX5Q02548 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAX5Q02548 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAX5Q02548 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAX5Q02548 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAX5Q02548 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAX5Q02548 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAX5Q02548 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAX5Q02548 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAX5Q02548 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAX5Q02548 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PAX5Q02548 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAX5Q02548 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAX5Q02548 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAX5Q02548 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAX5Q02548 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAX5Q02548 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAX5Q02548 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms