Protein–RNA interactions for Protein: P78560

CRADD, Death domain-containing protein CRADD, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRADDP78560 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CRADDP78560 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CRADDP78560 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CRADDP78560 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CRADDP78560 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CRADDP78560 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CRADDP78560 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CRADDP78560 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CRADDP78560 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CRADDP78560 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CRADDP78560 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CRADDP78560 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CRADDP78560 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CRADDP78560 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CRADDP78560 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CRADDP78560 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CRADDP78560 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CRADDP78560 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CRADDP78560 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CRADDP78560 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CRADDP78560 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CRADDP78560 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CRADDP78560 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRADDP78560 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRADDP78560 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRADDP78560 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRADDP78560 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRADDP78560 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CRADDP78560 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CRADDP78560 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CRADDP78560 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CRADDP78560 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CRADDP78560 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CRADDP78560 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CRADDP78560 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CRADDP78560 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CRADDP78560 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CRADDP78560 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CRADDP78560 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CRADDP78560 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CRADDP78560 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CRADDP78560 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRADDP78560 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRADDP78560 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CRADDP78560 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CRADDP78560 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CRADDP78560 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CRADDP78560 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CRADDP78560 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CRADDP78560 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CRADDP78560 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CRADDP78560 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CRADDP78560 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CRADDP78560 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CRADDP78560 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CRADDP78560 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CRADDP78560 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CRADDP78560 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CRADDP78560 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CRADDP78560 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CRADDP78560 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CRADDP78560 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRADDP78560 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRADDP78560 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRADDP78560 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRADDP78560 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRADDP78560 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRADDP78560 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CRADDP78560 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CRADDP78560 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CRADDP78560 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CRADDP78560 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CRADDP78560 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CRADDP78560 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CRADDP78560 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CRADDP78560 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CRADDP78560 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CRADDP78560 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CRADDP78560 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CRADDP78560 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CRADDP78560 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CRADDP78560 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CRADDP78560 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CRADDP78560 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CRADDP78560 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CRADDP78560 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRADDP78560 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRADDP78560 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRADDP78560 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRADDP78560 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRADDP78560 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRADDP78560 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRADDP78560 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRADDP78560 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRADDP78560 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRADDP78560 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRADDP78560 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CRADDP78560 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CRADDP78560 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CRADDP78560 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms