Protein–RNA interactions for Protein: P68036

UBE2L3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 L3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2L3P68036 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2L3P68036 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2L3P68036 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2L3P68036 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2L3P68036 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2L3P68036 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2L3P68036 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2L3P68036 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2L3P68036 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2L3P68036 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2L3P68036 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2L3P68036 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2L3P68036 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2L3P68036 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2L3P68036 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2L3P68036 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2L3P68036 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2L3P68036 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2L3P68036 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2L3P68036 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2L3P68036 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2L3P68036 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2L3P68036 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2L3P68036 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2L3P68036 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2L3P68036 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2L3P68036 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2L3P68036 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2L3P68036 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2L3P68036 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2L3P68036 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2L3P68036 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2L3P68036 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2L3P68036 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2L3P68036 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2L3P68036 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2L3P68036 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2L3P68036 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2L3P68036 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2L3P68036 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2L3P68036 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2L3P68036 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2L3P68036 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2L3P68036 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2L3P68036 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2L3P68036 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE2L3P68036 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.31■■□□□ 1
UBE2L3P68036 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2L3P68036 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2L3P68036 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2L3P68036 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2L3P68036 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2L3P68036 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2L3P68036 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2L3P68036 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2L3P68036 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2L3P68036 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2L3P68036 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2L3P68036 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2L3P68036 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
UBE2L3P68036 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
UBE2L3P68036 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2L3P68036 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2L3P68036 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2L3P68036 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2L3P68036 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2L3P68036 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2L3P68036 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE2L3P68036 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE2L3P68036 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2L3P68036 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2L3P68036 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE2L3P68036 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE2L3P68036 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE2L3P68036 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
UBE2L3P68036 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE2L3P68036 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE2L3P68036 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE2L3P68036 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2L3P68036 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2L3P68036 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2L3P68036 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2L3P68036 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE2L3P68036 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE2L3P68036 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE2L3P68036 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE2L3P68036 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2L3P68036 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2L3P68036 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2L3P68036 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2L3P68036 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE2L3P68036 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2L3P68036 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2L3P68036 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2L3P68036 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE2L3P68036 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE2L3P68036 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE2L3P68036 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE2L3P68036 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBE2L3P68036 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms