Protein–RNA interactions for Protein: P63124

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P63124 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
HERV-K104P63124 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERV-K104P63124 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERV-K104P63124 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERV-K104P63124 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERV-K104P63124 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HERV-K104P63124 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERV-K104P63124 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERV-K104P63124 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERV-K104P63124 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERV-K104P63124 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERV-K104P63124 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERV-K104P63124 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERV-K104P63124 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERV-K104P63124 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERV-K104P63124 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERV-K104P63124 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERV-K104P63124 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERV-K104P63124 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERV-K104P63124 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERV-K104P63124 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERV-K104P63124 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HERV-K104P63124 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERV-K104P63124 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERV-K104P63124 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERV-K104P63124 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERV-K104P63124 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERV-K104P63124 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERV-K104P63124 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERV-K104P63124 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERV-K104P63124 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERV-K104P63124 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERV-K104P63124 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERV-K104P63124 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERV-K104P63124 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERV-K104P63124 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERV-K104P63124 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERV-K104P63124 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERV-K104P63124 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERV-K104P63124 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERV-K104P63124 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERV-K104P63124 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERV-K104P63124 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERV-K104P63124 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERV-K104P63124 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
HERV-K104P63124 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
HERV-K104P63124 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERV-K104P63124 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERV-K104P63124 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERV-K104P63124 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERV-K104P63124 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERV-K104P63124 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERV-K104P63124 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERV-K104P63124 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERV-K104P63124 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERV-K104P63124 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERV-K104P63124 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERV-K104P63124 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERV-K104P63124 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERV-K104P63124 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERV-K104P63124 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERV-K104P63124 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HERV-K104P63124 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERV-K104P63124 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERV-K104P63124 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERV-K104P63124 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERV-K104P63124 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERV-K104P63124 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HERV-K104P63124 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERV-K104P63124 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERV-K104P63124 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERV-K104P63124 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERV-K104P63124 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERV-K104P63124 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HERV-K104P63124 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERV-K104P63124 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERV-K104P63124 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERV-K104P63124 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERV-K104P63124 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERV-K104P63124 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERV-K104P63124 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERV-K104P63124 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERV-K104P63124 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERV-K104P63124 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERV-K104P63124 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERV-K104P63124 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERV-K104P63124 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERV-K104P63124 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERV-K104P63124 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERV-K104P63124 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HERV-K104P63124 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERV-K104P63124 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERV-K104P63124 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERV-K104P63124 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERV-K104P63124 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERV-K104P63124 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERV-K104P63124 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERV-K104P63124 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERV-K104P63124 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERV-K104P63124 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms