Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS29P62273 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS29P62273 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS29P62273 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS29P62273 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS29P62273 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS29P62273 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS29P62273 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS29P62273 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS29P62273 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS29P62273 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS29P62273 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS29P62273 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS29P62273 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS29P62273 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS29P62273 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS29P62273 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS29P62273 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS29P62273 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS29P62273 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS29P62273 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPS29P62273 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPS29P62273 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPS29P62273 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPS29P62273 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPS29P62273 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPS29P62273 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPS29P62273 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPS29P62273 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS29P62273 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS29P62273 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS29P62273 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS29P62273 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS29P62273 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPS29P62273 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPS29P62273 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPS29P62273 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS29P62273 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS29P62273 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS29P62273 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS29P62273 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS29P62273 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS29P62273 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS29P62273 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS29P62273 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS29P62273 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS29P62273 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS29P62273 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS29P62273 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS29P62273 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS29P62273 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS29P62273 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPS29P62273 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPS29P62273 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPS29P62273 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPS29P62273 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RPS29P62273 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPS29P62273 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPS29P62273 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RPS29P62273 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPS29P62273 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPS29P62273 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPS29P62273 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPS29P62273 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPS29P62273 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS29P62273 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS29P62273 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS29P62273 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS29P62273 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS29P62273 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS29P62273 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS29P62273 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS29P62273 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS29P62273 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS29P62273 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS29P62273 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS29P62273 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS29P62273 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS29P62273 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS29P62273 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS29P62273 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS29P62273 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS29P62273 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS29P62273 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS29P62273 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS29P62273 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPS29P62273 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPS29P62273 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPS29P62273 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPS29P62273 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPS29P62273 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPS29P62273 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS29P62273 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS29P62273 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS29P62273 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS29P62273 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS29P62273 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS29P62273 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS29P62273 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS29P62273 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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