Protein–RNA interactions for Protein: P61236

YPEL3, Protein yippee-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YPEL3P61236 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
YPEL3P61236 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
YPEL3P61236 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
YPEL3P61236 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
YPEL3P61236 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
YPEL3P61236 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
YPEL3P61236 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
YPEL3P61236 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
YPEL3P61236 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
YPEL3P61236 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
YPEL3P61236 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
YPEL3P61236 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
YPEL3P61236 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
YPEL3P61236 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
YPEL3P61236 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
YPEL3P61236 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
YPEL3P61236 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
YPEL3P61236 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
YPEL3P61236 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
YPEL3P61236 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
YPEL3P61236 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
YPEL3P61236 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
YPEL3P61236 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
YPEL3P61236 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
YPEL3P61236 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
YPEL3P61236 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
YPEL3P61236 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YPEL3P61236 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
YPEL3P61236 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
YPEL3P61236 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
YPEL3P61236 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
YPEL3P61236 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
YPEL3P61236 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
YPEL3P61236 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
YPEL3P61236 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
YPEL3P61236 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
YPEL3P61236 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
YPEL3P61236 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
YPEL3P61236 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
YPEL3P61236 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
YPEL3P61236 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
YPEL3P61236 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
YPEL3P61236 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
YPEL3P61236 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
YPEL3P61236 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
YPEL3P61236 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
YPEL3P61236 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
YPEL3P61236 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YPEL3P61236 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
YPEL3P61236 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
YPEL3P61236 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
YPEL3P61236 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YPEL3P61236 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
YPEL3P61236 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
YPEL3P61236 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
YPEL3P61236 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
YPEL3P61236 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
YPEL3P61236 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
YPEL3P61236 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
YPEL3P61236 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
YPEL3P61236 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
YPEL3P61236 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
YPEL3P61236 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
YPEL3P61236 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
YPEL3P61236 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
YPEL3P61236 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
YPEL3P61236 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
YPEL3P61236 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YPEL3P61236 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
YPEL3P61236 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
YPEL3P61236 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YPEL3P61236 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
YPEL3P61236 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YPEL3P61236 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
YPEL3P61236 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
YPEL3P61236 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
YPEL3P61236 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
YPEL3P61236 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
YPEL3P61236 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
YPEL3P61236 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
YPEL3P61236 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
YPEL3P61236 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
YPEL3P61236 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
YPEL3P61236 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
YPEL3P61236 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
YPEL3P61236 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
YPEL3P61236 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
YPEL3P61236 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
YPEL3P61236 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
YPEL3P61236 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
YPEL3P61236 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YPEL3P61236 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YPEL3P61236 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
YPEL3P61236 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YPEL3P61236 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YPEL3P61236 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
YPEL3P61236 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.27■■□□□ 1
YPEL3P61236 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
YPEL3P61236 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
YPEL3P61236 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms