Protein–RNA interactions for Protein: P60983

GMFB, Glia maturation factor beta, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMFBP60983 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GMFBP60983 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GMFBP60983 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GMFBP60983 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GMFBP60983 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GMFBP60983 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GMFBP60983 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GMFBP60983 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GMFBP60983 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GMFBP60983 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GMFBP60983 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GMFBP60983 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GMFBP60983 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GMFBP60983 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GMFBP60983 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GMFBP60983 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GMFBP60983 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GMFBP60983 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GMFBP60983 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GMFBP60983 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GMFBP60983 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GMFBP60983 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GMFBP60983 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GMFBP60983 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GMFBP60983 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GMFBP60983 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GMFBP60983 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GMFBP60983 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GMFBP60983 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GMFBP60983 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GMFBP60983 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GMFBP60983 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GMFBP60983 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GMFBP60983 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GMFBP60983 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GMFBP60983 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GMFBP60983 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GMFBP60983 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GMFBP60983 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GMFBP60983 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GMFBP60983 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GMFBP60983 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GMFBP60983 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GMFBP60983 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GMFBP60983 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GMFBP60983 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GMFBP60983 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GMFBP60983 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GMFBP60983 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GMFBP60983 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GMFBP60983 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GMFBP60983 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GMFBP60983 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GMFBP60983 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GMFBP60983 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GMFBP60983 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GMFBP60983 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GMFBP60983 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GMFBP60983 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GMFBP60983 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GMFBP60983 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GMFBP60983 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GMFBP60983 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GMFBP60983 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GMFBP60983 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GMFBP60983 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GMFBP60983 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GMFBP60983 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GMFBP60983 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GMFBP60983 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GMFBP60983 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GMFBP60983 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GMFBP60983 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GMFBP60983 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GMFBP60983 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GMFBP60983 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GMFBP60983 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GMFBP60983 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GMFBP60983 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GMFBP60983 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GMFBP60983 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GMFBP60983 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GMFBP60983 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GMFBP60983 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GMFBP60983 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GMFBP60983 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GMFBP60983 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GMFBP60983 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GMFBP60983 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GMFBP60983 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GMFBP60983 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GMFBP60983 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GMFBP60983 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GMFBP60983 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GMFBP60983 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GMFBP60983 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GMFBP60983 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GMFBP60983 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GMFBP60983 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GMFBP60983 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms